52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4112 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  51.83 
 
 		 657 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 667 aa  1363    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  52.12 
 
 		 677 aa  670    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  47.79 
 
 		 658 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  48.25 
 
 		 655 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.93 
 
 		 655 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.06 
 
 		 657 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  44.44 
 
 		 668 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.24 
 
 		 645 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  41.08 
 
 		 638 aa  445  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  38.47 
 
 		 620 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  38.39 
 
 		 730 aa  286  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.28 
 
 		 951 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  22.07 
 
 		 1129 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.19 
 
 		 1193 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.47 
 
 		 600 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.41 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  23.85 
 
 		 569 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  22.72 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.19 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.98 
 
 		 1189 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.42 
 
 		 1183 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  21.63 
 
 		 604 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.36 
 
 		 1225 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.12 
 
 		 1236 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  22.33 
 
 		 1166 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.29 
 
 		 1114 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  21.28 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  24.51 
 
 		 1161 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  21.21 
 
 		 1109 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  20.31 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  21.18 
 
 		 1208 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  22.55 
 
 		 1127 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  21 
 
 		 1203 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.88 
 
 		 1246 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.3 
 
 		 1208 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  20.82 
 
 		 1088 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.75 
 
 		 1170 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  24.27 
 
 		 566 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  24.93 
 
 		 1107 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.69 
 
 		 1192 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.73 
 
 		 1228 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  24.67 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  21.91 
 
 		 583 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  22.42 
 
 		 1172 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.68 
 
 		 1226 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  25.45 
 
 		 1098 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  22.91 
 
 		 585 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.63 
 
 		 1113 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  25.56 
 
 		 1120 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  20.73 
 
 		 556 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  21.46 
 
 		 577 aa  44.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>