51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4537 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 402 aa  826    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  50.26 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  41.07 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  34.99 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  34.5 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  28.62 
 
 		 895 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.03 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.76 
 
 		 2807 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  24.83 
 
 		 1838 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4551  FG-GAP repeat protein  29.44 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  22.59 
 
 		 2413 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  23.88 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  25.37 
 
 		 811 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  25.12 
 
 		 1433 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3929  FG-GAP repeat protein  21.35 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  22.96 
 
 		 1437 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  25.89 
 
 		 828 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  22.73 
 
 		 752 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  22.16 
 
 		 566 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6276  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  26.29 
 
 		 2652 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  21.79 
 
 		 1348 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2753  FG-GAP repeat-containing protein  23.19 
 
 		 797 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  26.24 
 
 		 1527 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  23.33 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  27.62 
 
 		 720 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  25.34 
 
 		 2513 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.29 
 
 		 2194 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.97 
 
 		 1073 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.16 
 
 		 1222 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  26.3 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  23.11 
 
 		 1019 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  23.62 
 
 		 2558 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  24.21 
 
 		 1490 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  23.92 
 
 		 1337 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.71 
 
 		 1126 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.6 
 
 		 1225 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.54 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  24.67 
 
 		 667 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 621 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  27.18 
 
 		 2762 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  21.7 
 
 		 510 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1517 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  23.41 
 
 		 1124 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  25.43 
 
 		 974 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.79 
 
 		 1118 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  23.27 
 
 		 1346 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1638 aa  43.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  24.45 
 
 		 590 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.08 
 
 		 1557 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.31 
 
 		 1113 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>