21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3417 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3417  esterase  100 
 
 		 379 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  60.17 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  34.5 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  32.11 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  33.61 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  33.5 
 
 		 895 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.72 
 
 		 1838 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  28.33 
 
 		 2497 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2753  FG-GAP repeat-containing protein  28.88 
 
 		 797 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  31.16 
 
 		 1022 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.19 
 
 		 2807 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  33.15 
 
 		 921 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  30.18 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25.17 
 
 		 616 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.22 
 
 		 828 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  25.28 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  22.94 
 
 		 4379 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  23.3 
 
 		 1126 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3929  FG-GAP repeat protein  28.66 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  24.32 
 
 		 1557 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>