104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1256 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  100 
 
 
590 aa  1186    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  43.62 
 
 
566 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.27 
 
 
803 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
1127 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.35 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.69 
 
 
556 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  26.52 
 
 
577 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  24.2 
 
 
593 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.15 
 
 
737 aa  73.9  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25.93 
 
 
604 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  28.24 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.32 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.83 
 
 
593 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.55 
 
 
574 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  21.69 
 
 
1088 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.97 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  24.71 
 
 
1208 aa  67.4  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  29.3 
 
 
1124 aa  67  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  25.52 
 
 
649 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  35 
 
 
1161 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.86 
 
 
1126 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.1 
 
 
574 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  24.93 
 
 
1098 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.84 
 
 
1490 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.11 
 
 
1275 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.88 
 
 
1127 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.71 
 
 
604 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.48 
 
 
1129 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  31.58 
 
 
1120 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.74 
 
 
604 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  25.38 
 
 
573 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  25.24 
 
 
583 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  27.18 
 
 
562 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.28 
 
 
1114 aa  60.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.85 
 
 
1126 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.82 
 
 
600 aa  60.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.73 
 
 
1208 aa  60.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  27.62 
 
 
655 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.52 
 
 
645 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.57 
 
 
1109 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.22 
 
 
1203 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.99 
 
 
3197 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.69 
 
 
1189 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  24.03 
 
 
1575 aa  58.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.81 
 
 
891 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.86 
 
 
1193 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  29.75 
 
 
1098 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  24.09 
 
 
585 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  28.62 
 
 
438 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.03 
 
 
1172 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.27 
 
 
551 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.4 
 
 
11716 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.84 
 
 
2807 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.24 
 
 
1228 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.2 
 
 
1236 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.44 
 
 
3197 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.89 
 
 
691 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.27 
 
 
1226 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.72 
 
 
1019 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.14 
 
 
1225 aa  53.9  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30.19 
 
 
974 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.96 
 
 
1246 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  29.52 
 
 
1166 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  26.41 
 
 
917 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  29.11 
 
 
1183 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  27.24 
 
 
872 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.23 
 
 
585 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  21.87 
 
 
402 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  24.65 
 
 
1838 aa  51.2  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.43 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.53 
 
 
1192 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  26.24 
 
 
494 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.93 
 
 
499 aa  50.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  28.44 
 
 
1434 aa  50.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  24.89 
 
 
517 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  24.29 
 
 
1557 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  28.46 
 
 
412 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.03 
 
 
1170 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  28.97 
 
 
433 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  26.36 
 
 
456 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.96 
 
 
472 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.91 
 
 
2194 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  29.08 
 
 
828 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.59 
 
 
554 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27.15 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.36 
 
 
469 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  26.34 
 
 
646 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.92 
 
 
1113 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.84 
 
 
404 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.58 
 
 
616 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.2 
 
 
1066 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  25.13 
 
 
730 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  25.09 
 
 
4379 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  26.94 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  29.52 
 
 
1107 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.7 
 
 
1118 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.68 
 
 
1009 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  27.45 
 
 
437 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.88 
 
 
8871 aa  44.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.81 
 
 
1113 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>