93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0493 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 437 aa  872    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  46.65 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  46.25 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  42.15 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  42.65 
 
 		 438 aa  319  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  27.44 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  26.19 
 
 		 506 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  29.41 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  27.67 
 
 		 521 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  26.11 
 
 		 524 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  26.75 
 
 		 523 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.12 
 
 		 1838 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1289 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  25.73 
 
 		 828 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.16 
 
 		 1225 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.67 
 
 		 1126 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.78 
 
 		 1113 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  28.76 
 
 		 4379 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.06 
 
 		 1340 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.25 
 
 		 2194 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  29.41 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.3 
 
 		 2807 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.64 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.38 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.32 
 
 		 616 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.69 
 
 		 974 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.8 
 
 		 1490 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  24.85 
 
 		 872 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  25.07 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.93 
 
 		 1118 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.88 
 
 		 1203 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.66 
 
 		 1019 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.2 
 
 		 1557 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  24.19 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  24.93 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  26.77 
 
 		 813 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  23.81 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.57 
 
 		 569 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.41 
 
 		 803 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.16 
 
 		 1192 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1210 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1127 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.01 
 
 		 889 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  25 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  26.2 
 
 		 1124 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.01 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.17 
 
 		 1009 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 1222 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  25.6 
 
 		 494 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  29.26 
 
 		 1527 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  26.02 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.03 
 
 		 891 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.38 
 
 		 1275 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.59 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.5 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  25.96 
 
 		 664 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  24.29 
 
 		 2474 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.24 
 
 		 1129 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  22.94 
 
 		 573 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  26.15 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  31.58 
 
 		 1172 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.05 
 
 		 1114 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.32 
 
 		 1225 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  30.58 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  24.53 
 
 		 389 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27 
 
 		 1113 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  27.85 
 
 		 895 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 		 1282 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.64 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.55 
 
 		 1337 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.45 
 
 		 1109 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.8 
 
 		 11716 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  24.4 
 
 		 3197 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.17 
 
 		 1246 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25.97 
 
 		 604 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.94 
 
 		 8871 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.44 
 
 		 1012 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.67 
 
 		 1066 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.27 
 
 		 1228 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.51 
 
 		 1189 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.36 
 
 		 1346 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.38 
 
 		 1348 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  24.84 
 
 		 1183 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  28.09 
 
 		 1088 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  24.77 
 
 		 1437 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  28.3 
 
 		 1120 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.69 
 
 		 593 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.6 
 
 		 1236 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  26.5 
 
 		 685 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  30.53 
 
 		 1098 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  28.86 
 
 		 566 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>