122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0460 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  100 
 
 		 1124 aa  2230    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.3 
 
 		 1126 aa  188  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32.81 
 
 		 1490 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  30.52 
 
 		 604 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  35.07 
 
 		 1207 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1638 aa  105  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.03 
 
 		 872 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.51 
 
 		 891 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  27.98 
 
 		 828 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.99 
 
 		 1340 aa  98.6  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.6 
 
 		 1019 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.06 
 
 		 1118 aa  95.5  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.71 
 
 		 1222 aa  94.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.18 
 
 		 974 aa  92  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.96 
 
 		 2194 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  30.62 
 
 		 1275 aa  89.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.33 
 
 		 1838 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.04 
 
 		 889 aa  87  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.47 
 
 		 1113 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.46 
 
 		 1251 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  38.51 
 
 		 1478 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.52 
 
 		 2807 aa  81.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  31.97 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.16 
 
 		 1557 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  32.35 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  28.57 
 
 		 554 aa  75.5  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0459  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.74 
 
 		 1193 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245222  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.38 
 
 		 1009 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.76 
 
 		 3197 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  28.32 
 
 		 494 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.37 
 
 		 616 aa  73.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  28.61 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.25 
 
 		 1225 aa  71.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.79 
 
 		 4379 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  27.3 
 
 		 813 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 621 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  25.8 
 
 		 917 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  31.72 
 
 		 663 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.61 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1233 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1321 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  28.44 
 
 		 685 aa  66.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1289 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  30.3 
 
 		 6272 aa  63.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.73 
 
 		 959 aa  61.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  23.56 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  30.83 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  29.28 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  29.63 
 
 		 590 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.86 
 
 		 1114 aa  57.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.74 
 
 		 1189 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 		 11716 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.1 
 
 		 3197 aa  57.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.84 
 
 		 600 aa  55.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  33.33 
 
 		 523 aa  55.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  25.4 
 
 		 556 aa  55.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.06 
 
 		 574 aa  54.7  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  27.74 
 
 		 517 aa  54.7  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  25.9 
 
 		 593 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.84 
 
 		 593 aa  54.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  25 
 
 		 1210 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.03 
 
 		 649 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  27.66 
 
 		 485 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.31 
 
 		 546 aa  53.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  31.06 
 
 		 573 aa  52.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1575 aa  52.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.72 
 
 		 1246 aa  52.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.26 
 
 		 1226 aa  52.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  24.84 
 
 		 583 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  25.62 
 
 		 438 aa  52  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  25.61 
 
 		 604 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.97 
 
 		 1348 aa  51.6  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1127 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  28.81 
 
 		 577 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.05 
 
 		 1236 aa  50.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.67 
 
 		 1109 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  32.31 
 
 		 510 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  32.26 
 
 		 524 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  28.1 
 
 		 1976 aa  50.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.89 
 
 		 1012 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  27.87 
 
 		 539 aa  50.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.24 
 
 		 1172 aa  50.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.5 
 
 		 1192 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  24.35 
 
 		 437 aa  50.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01580  conserved expressed protein  32.33 
 
 		 690 aa  49.3  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  36.07 
 
 		 1245 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  37.33 
 
 		 3474 aa  48.9  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  24.36 
 
 		 2513 aa  48.9  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.08 
 
 		 1154 aa  48.5  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0071  hypothetical protein  39.56 
 
 		 1034 aa  48.1  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 404 aa  48.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  24.35 
 
 		 604 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  25 
 
 		 803 aa  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  33.33 
 
 		 1098 aa  47.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.89 
 
 		 1193 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.86 
 
 		 1228 aa  47.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.67 
 
 		 1170 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  28.45 
 
 		 1437 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.96 
 
 		 1113 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>