106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0490 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 
1225 aa  2451    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  63.63 
 
 
1236 aa  1487    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  55.1 
 
 
1193 aa  1187    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.02 
 
 
1208 aa  1412    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  61.33 
 
 
1228 aa  1385    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  61.68 
 
 
1246 aa  1414    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  63.17 
 
 
1192 aa  1418    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  43.88 
 
 
1114 aa  835    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  59.83 
 
 
1170 aa  1332    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.07 
 
 
1226 aa  1409    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.15 
 
 
1189 aa  958    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  34.13 
 
 
1183 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  31.82 
 
 
1208 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  31.62 
 
 
1203 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  33.36 
 
 
1113 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  33.42 
 
 
1172 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  36.27 
 
 
1120 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  31.73 
 
 
1127 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  32.56 
 
 
1129 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  34.07 
 
 
1098 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  31.46 
 
 
1109 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  30.24 
 
 
1166 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  31.15 
 
 
1161 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  32.13 
 
 
1126 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  30.16 
 
 
1088 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  31.8 
 
 
1098 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  29.18 
 
 
1107 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  29.83 
 
 
593 aa  207  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  30.63 
 
 
604 aa  194  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  31.66 
 
 
593 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.04 
 
 
551 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.46 
 
 
546 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  30.79 
 
 
583 aa  179  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.23 
 
 
1066 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  29.48 
 
 
649 aa  167  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.85 
 
 
600 aa  163  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  29.74 
 
 
556 aa  157  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  29.58 
 
 
604 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  30.05 
 
 
577 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.59 
 
 
574 aa  151  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.9 
 
 
803 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.03 
 
 
596 aa  149  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  29.89 
 
 
566 aa  148  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.46 
 
 
737 aa  147  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.58 
 
 
569 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  29.13 
 
 
562 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.52 
 
 
573 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.92 
 
 
1575 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.29 
 
 
573 aa  129  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  28.21 
 
 
585 aa  118  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.57 
 
 
585 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.62 
 
 
951 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.73 
 
 
657 aa  99  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  33.82 
 
 
574 aa  98.2  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
1127 aa  97.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.87 
 
 
691 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.95 
 
 
668 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  24.95 
 
 
655 aa  88.2  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.4 
 
 
1040 aa  87.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.03 
 
 
554 aa  87.4  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.57 
 
 
681 aa  81.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  33.33 
 
 
499 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.08 
 
 
655 aa  77.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.11 
 
 
655 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.29 
 
 
677 aa  74.3  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.9 
 
 
638 aa  73.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.45 
 
 
526 aa  72  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.28 
 
 
492 aa  71.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  27.36 
 
 
878 aa  70.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  24.5 
 
 
658 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.84 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 
1184 aa  68.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  25.5 
 
 
667 aa  68.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.83 
 
 
645 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  22.31 
 
 
657 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  29.28 
 
 
521 aa  59.7  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.89 
 
 
8871 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  29.75 
 
 
482 aa  59.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.77 
 
 
455 aa  58.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  24.3 
 
 
730 aa  58.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  28.71 
 
 
768 aa  57.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.27 
 
 
3197 aa  57  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.88 
 
 
447 aa  56.2  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  26.44 
 
 
685 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.13 
 
 
1838 aa  53.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.08 
 
 
1126 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  27.49 
 
 
685 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  28.16 
 
 
1490 aa  53.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.8 
 
 
604 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  34.21 
 
 
1133 aa  53.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  29.55 
 
 
412 aa  53.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  32.47 
 
 
590 aa  53.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  23.72 
 
 
645 aa  52.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  26.09 
 
 
437 aa  52.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.36 
 
 
469 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.76 
 
 
3197 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
1138 aa  50.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  24.19 
 
 
1124 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  30.43 
 
 
566 aa  49.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  31.03 
 
 
758 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>