118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3233 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  47.71 
 
 		 1225 aa  952    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  50.29 
 
 		 1236 aa  1038    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.13 
 
 		 1193 aa  913    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.49 
 
 		 1208 aa  1000    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.5 
 
 		 1228 aa  934    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  47.3 
 
 		 1246 aa  969    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  49.87 
 
 		 1192 aa  983    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  41.85 
 
 		 1114 aa  741    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  46.92 
 
 		 1170 aa  911    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  47.97 
 
 		 1226 aa  957    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 1189 aa  2384    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  33 
 
 		 1203 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  32.92 
 
 		 1127 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  32.3 
 
 		 1183 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  34.43 
 
 		 1120 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  31.48 
 
 		 1208 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  33.07 
 
 		 1172 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  31.15 
 
 		 1129 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  33.91 
 
 		 1098 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  31.51 
 
 		 1166 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  31.6 
 
 		 1126 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  31.48 
 
 		 1109 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  31.03 
 
 		 1161 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  31.02 
 
 		 1113 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  29.18 
 
 		 1088 aa  413  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  31.45 
 
 		 1098 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  30.99 
 
 		 1107 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  32.24 
 
 		 593 aa  195  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  29.08 
 
 		 604 aa  183  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  28.22 
 
 		 593 aa  181  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.87 
 
 		 556 aa  176  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.8 
 
 		 551 aa  173  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  30.02 
 
 		 573 aa  172  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  32.45 
 
 		 604 aa  168  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  30.82 
 
 		 583 aa  166  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  30.12 
 
 		 649 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.15 
 
 		 600 aa  164  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  30.71 
 
 		 803 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.27 
 
 		 1066 aa  158  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.37 
 
 		 546 aa  152  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.28 
 
 		 569 aa  145  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.7 
 
 		 737 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.4 
 
 		 596 aa  138  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.73 
 
 		 574 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  27.56 
 
 		 577 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.93 
 
 		 562 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.85 
 
 		 1040 aa  131  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.93 
 
 		 574 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  31.08 
 
 		 566 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.87 
 
 		 585 aa  119  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1575 aa  113  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.38 
 
 		 573 aa  112  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.59 
 
 		 554 aa  110  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.35 
 
 		 668 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.15 
 
 		 585 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1127 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.29 
 
 		 499 aa  91.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.87 
 
 		 655 aa  90.1  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  26 
 
 		 655 aa  89.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  24.48 
 
 		 951 aa  89.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  32.64 
 
 		 878 aa  86.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.56 
 
 		 658 aa  81.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.21 
 
 		 521 aa  80.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.42 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.66 
 
 		 638 aa  79  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.18 
 
 		 655 aa  78.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.27 
 
 		 657 aa  77.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.99 
 
 		 677 aa  75.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.51 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  26.96 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 645 aa  72.4  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  24.2 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.73 
 
 		 681 aa  72  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.46 
 
 		 730 aa  71.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.64 
 
 		 526 aa  67.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  29.33 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.21 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  23.31 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.15 
 
 		 1838 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  23.59 
 
 		 2807 aa  61.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  26.4 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  31.82 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1184 aa  59.3  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.72 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  24.53 
 
 		 1490 aa  58.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  26.74 
 
 		 1124 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  26.64 
 
 		 645 aa  57  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  28.96 
 
 		 1282 aa  56.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.28 
 
 		 1019 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.91 
 
 		 3197 aa  54.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27.27 
 
 		 447 aa  54.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  28.42 
 
 		 616 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.83 
 
 		 1126 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  26.16 
 
 		 646 aa  53.5  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 1138 aa  53.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.97 
 
 		 974 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.27 
 
 		 8871 aa  52.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.78 
 
 		 889 aa  52  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  25.73 
 
 		 1275 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  31.91 
 
 		 604 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>