65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4117 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 
655 aa  1314    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  64.23 
 
 
655 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  53.05 
 
 
677 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  61.76 
 
 
658 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  59.6 
 
 
657 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  48.25 
 
 
667 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  51 
 
 
645 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  49.85 
 
 
668 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  48.72 
 
 
638 aa  581  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  44.72 
 
 
657 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  42.66 
 
 
620 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  43.58 
 
 
730 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.16 
 
 
951 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24.2 
 
 
593 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  26.45 
 
 
1183 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.44 
 
 
600 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  23.85 
 
 
1129 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.6 
 
 
604 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.71 
 
 
1208 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25 
 
 
604 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  31.62 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.91 
 
 
1066 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.74 
 
 
1208 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.4 
 
 
1225 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.04 
 
 
1236 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  22.75 
 
 
556 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.69 
 
 
1192 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.02 
 
 
1189 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  23.46 
 
 
583 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.15 
 
 
1114 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  29.54 
 
 
492 aa  64.3  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  24.51 
 
 
649 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  23.35 
 
 
593 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 
1246 aa  61.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.89 
 
 
1228 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  24.86 
 
 
562 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  22.25 
 
 
1203 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  23.73 
 
 
577 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  23.22 
 
 
566 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.04 
 
 
546 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  22.41 
 
 
1107 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.06 
 
 
1226 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  22.65 
 
 
1088 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.35 
 
 
1193 aa  57.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  21.99 
 
 
585 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.49 
 
 
1170 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  28.53 
 
 
521 aa  53.5  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  23.23 
 
 
573 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.35 
 
 
691 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  21.76 
 
 
569 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.62 
 
 
526 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.62 
 
 
585 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  24.66 
 
 
803 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  20.86 
 
 
1109 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.28 
 
 
1040 aa  48.9  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  22.42 
 
 
1098 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.72 
 
 
453 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.99 
 
 
1490 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.17 
 
 
574 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  20.99 
 
 
1127 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  25.49 
 
 
1098 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
1127 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.05 
 
 
2194 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.04 
 
 
455 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  35.29 
 
 
1126 aa  43.9  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>