87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1428 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1138 aa  2266    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 1127 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 		 1184 aa  257  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 1104 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1133 aa  157  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  23.65 
 
 		 556 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.79 
 
 		 593 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.1 
 
 		 1126 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  32.35 
 
 		 1183 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.17 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.04 
 
 		 3197 aa  63.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.62 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  23.58 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  26.75 
 
 		 1161 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  24.88 
 
 		 573 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  22.87 
 
 		 569 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  31.78 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  22.86 
 
 		 604 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  37.19 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  24.37 
 
 		 1166 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 942 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 189 aa  58.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.79 
 
 		 1113 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1575 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  21.96 
 
 		 655 aa  55.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  24.56 
 
 		 3197 aa  55.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.25 
 
 		 1838 aa  55.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.46 
 
 		 604 aa  54.7  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.4 
 
 		 872 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.52 
 
 		 453 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  25.99 
 
 		 469 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.13 
 
 		 1170 aa  53.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.41 
 
 		 807 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1289 aa  52.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  27.54 
 
 		 1109 aa  52.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  24.56 
 
 		 1019 aa  52  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.49 
 
 		 1226 aa  51.6  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  33.12 
 
 		 792 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  24.75 
 
 		 1275 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.76 
 
 		 1118 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.58 
 
 		 593 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.92 
 
 		 1225 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.67 
 
 		 4379 aa  50.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.77 
 
 		 1225 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 613 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1753  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 1014 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 866 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.5 
 
 		 1228 aa  50.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 934 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  21.52 
 
 		 562 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.96 
 
 		 1192 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.61 
 
 		 935 aa  49.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  23.24 
 
 		 1557 aa  48.5  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.49 
 
 		 1208 aa  48.5  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.19 
 
 		 604 aa  48.5  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 827 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.37 
 
 		 1222 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  30.08 
 
 		 1208 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.39 
 
 		 801 aa  47.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.06 
 
 		 551 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  25.78 
 
 		 482 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.91 
 
 		 1340 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.35 
 
 		 1040 aa  47  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 581 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  27.71 
 
 		 816 aa  46.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1129 aa  46.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  31.4 
 
 		 1098 aa  46.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.16 
 
 		 737 aa  46.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  24.92 
 
 		 3474 aa  46.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.4 
 
 		 1490 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  23.94 
 
 		 974 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.55 
 
 		 1221 aa  45.8  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.65 
 
 		 1246 aa  46.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  24.67 
 
 		 437 aa  45.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  22.76 
 
 		 2513 aa  45.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0711  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 1113 aa  45.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.357595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0954  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 350 aa  45.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00136407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.02 
 
 		 828 aa  45.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.29 
 
 		 596 aa  45.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.24 
 
 		 889 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.54 
 
 		 621 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  28.43 
 
 		 174 aa  45.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  27.73 
 
 		 1203 aa  45.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 808 aa  44.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.62 
 
 		 2807 aa  45.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.93 
 
 		 1193 aa  44.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1638 aa  44.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>