114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0319 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  100 
 
 
649 aa  1327    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  51.4 
 
 
556 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  49.17 
 
 
583 aa  455  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  45.81 
 
 
604 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  43.09 
 
 
593 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  40.73 
 
 
569 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  39.42 
 
 
573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.23 
 
 
551 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  40.62 
 
 
593 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.57 
 
 
600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  38.16 
 
 
562 aa  316  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  35.93 
 
 
577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.42 
 
 
596 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.18 
 
 
546 aa  284  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  34.9 
 
 
574 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.43 
 
 
574 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  34.09 
 
 
604 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.98 
 
 
585 aa  193  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.68 
 
 
1192 aa  180  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.17 
 
 
1236 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.94 
 
 
1129 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.01 
 
 
1208 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.65 
 
 
1193 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.19 
 
 
1246 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.85 
 
 
1114 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  28.37 
 
 
1120 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  30.88 
 
 
803 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.93 
 
 
1228 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  27.32 
 
 
1109 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.3 
 
 
1088 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.12 
 
 
1189 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.36 
 
 
1170 aa  153  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.64 
 
 
1098 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.83 
 
 
1225 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.57 
 
 
737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.35 
 
 
1208 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.1 
 
 
1226 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  29.34 
 
 
1107 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  28.77 
 
 
1161 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 
1126 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.73 
 
 
1127 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
1127 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.57 
 
 
1575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  27.58 
 
 
1166 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  28.84 
 
 
691 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  28.08 
 
 
1183 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  28.1 
 
 
951 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.56 
 
 
1098 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.65 
 
 
585 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.99 
 
 
1113 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.39 
 
 
1066 aa  113  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.03 
 
 
554 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  24.49 
 
 
1172 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.09 
 
 
1203 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  27.58 
 
 
655 aa  100  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.31 
 
 
492 aa  99.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  27.99 
 
 
521 aa  96.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 
453 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 
1184 aa  95.5  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.41 
 
 
499 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.2 
 
 
566 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.4 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.84 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.32 
 
 
657 aa  70.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.57 
 
 
1019 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.89 
 
 
1040 aa  67.8  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.87 
 
 
590 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  29.28 
 
 
447 aa  65.1  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  28.97 
 
 
878 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.43 
 
 
1838 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.88 
 
 
1275 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  21.95 
 
 
685 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  24.51 
 
 
655 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.35 
 
 
526 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  21.95 
 
 
685 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.96 
 
 
1126 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  23.08 
 
 
645 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.01 
 
 
1490 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  22.65 
 
 
681 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  26.8 
 
 
469 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.95 
 
 
655 aa  58.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.41 
 
 
2807 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  21.28 
 
 
667 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.13 
 
 
3197 aa  55.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.92 
 
 
658 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  26.47 
 
 
730 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  25.7 
 
 
604 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  26.03 
 
 
1124 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  36.45 
 
 
646 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  33.59 
 
 
872 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  25.81 
 
 
974 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  25.38 
 
 
668 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.86 
 
 
1289 aa  51.2  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.32 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  25.38 
 
 
3197 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  24.05 
 
 
482 aa  50.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  25.37 
 
 
828 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  31.14 
 
 
8871 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  24.56 
 
 
566 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 
685 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>