124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1690 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  100 
 
 
562 aa  1145    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  55.79 
 
 
573 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  47.42 
 
 
577 aa  490  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  46.25 
 
 
574 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  42.35 
 
 
569 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  41.82 
 
 
556 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  40.78 
 
 
604 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.07 
 
 
600 aa  355  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  37.9 
 
 
593 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  38.16 
 
 
649 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  36.03 
 
 
593 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  38.32 
 
 
604 aa  302  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  38.17 
 
 
583 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.38 
 
 
546 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.58 
 
 
551 aa  296  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.6 
 
 
574 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.21 
 
 
596 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.71 
 
 
585 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.16 
 
 
1208 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  32.03 
 
 
803 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  32.34 
 
 
1098 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.53 
 
 
1246 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
1127 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.66 
 
 
1170 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  30.13 
 
 
1129 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  27.29 
 
 
1208 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.47 
 
 
1192 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.81 
 
 
1226 aa  157  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.55 
 
 
1228 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.34 
 
 
737 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.53 
 
 
1193 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.87 
 
 
1120 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.12 
 
 
1236 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.95 
 
 
1225 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  28.42 
 
 
1088 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  28.11 
 
 
1183 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.4 
 
 
951 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  28.37 
 
 
585 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.55 
 
 
1114 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.1 
 
 
1189 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  28.08 
 
 
1109 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  28.72 
 
 
499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
1184 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  28.41 
 
 
1107 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.6 
 
 
1127 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.49 
 
 
1066 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  29.13 
 
 
1098 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  27.43 
 
 
1166 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  25.93 
 
 
1113 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  27.39 
 
 
1575 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  28.45 
 
 
1172 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  26.38 
 
 
1161 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  27.97 
 
 
691 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.54 
 
 
526 aa  93.6  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.1 
 
 
645 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.86 
 
 
554 aa  90.5  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.97 
 
 
521 aa  90.5  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  24.25 
 
 
1203 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.78 
 
 
453 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  28.53 
 
 
1126 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  25.7 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.9 
 
 
566 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.09 
 
 
638 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  24.9 
 
 
655 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.36 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.06 
 
 
655 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  25.73 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.01 
 
 
1490 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  28.23 
 
 
878 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.93 
 
 
655 aa  72.8  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.4 
 
 
455 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  26.28 
 
 
658 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.09 
 
 
1040 aa  68.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.21 
 
 
668 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22.91 
 
 
685 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  22.91 
 
 
685 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.69 
 
 
657 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.88 
 
 
1340 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  29.94 
 
 
645 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.63 
 
 
1222 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.9 
 
 
1838 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.36 
 
 
1019 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.27 
 
 
573 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.78 
 
 
2194 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.18 
 
 
1126 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  24.87 
 
 
646 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.63 
 
 
3197 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.71 
 
 
891 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
1104 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  26.79 
 
 
616 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  24.66 
 
 
974 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.72 
 
 
677 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.39 
 
 
3197 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.17 
 
 
1113 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.35 
 
 
1275 aa  53.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  20.98 
 
 
681 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.16 
 
 
1009 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  30.97 
 
 
482 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  24.56 
 
 
667 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.44 
 
 
1138 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>