118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2951 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 
596 aa  1211    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  49.19 
 
 
551 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  47.04 
 
 
546 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  37.76 
 
 
569 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.84 
 
 
574 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  41.42 
 
 
593 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  40.22 
 
 
556 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  39.42 
 
 
649 aa  323  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  37.1 
 
 
583 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  37.82 
 
 
577 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  36.2 
 
 
573 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.66 
 
 
600 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  37.68 
 
 
604 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  34.45 
 
 
593 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  37.09 
 
 
604 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  36.07 
 
 
562 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.92 
 
 
585 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  33.39 
 
 
574 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  30.02 
 
 
1109 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  29.79 
 
 
1129 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  28.64 
 
 
1183 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  31.36 
 
 
803 aa  170  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  29.43 
 
 
1113 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.37 
 
 
1170 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  28.36 
 
 
1126 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.71 
 
 
1114 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  31.34 
 
 
1098 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.88 
 
 
1127 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.06 
 
 
1192 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  28.27 
 
 
1088 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.46 
 
 
1193 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.26 
 
 
1120 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.36 
 
 
1208 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.44 
 
 
1208 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.43 
 
 
1228 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.21 
 
 
1246 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.69 
 
 
1236 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
1127 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.38 
 
 
585 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.9 
 
 
1226 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  27.88 
 
 
1098 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  28.76 
 
 
1107 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.04 
 
 
737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  29.19 
 
 
1172 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.03 
 
 
1225 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.12 
 
 
1166 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.6 
 
 
1189 aa  130  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  27.44 
 
 
1203 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 
1575 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.14 
 
 
1066 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.72 
 
 
1161 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  28.75 
 
 
951 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.57 
 
 
554 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.77 
 
 
453 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  34.22 
 
 
499 aa  97.1  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.05 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.03 
 
 
691 aa  94.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
1184 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  28.7 
 
 
482 aa  88.2  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.88 
 
 
655 aa  84  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  26.39 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.27 
 
 
566 aa  77  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.42 
 
 
1838 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.02 
 
 
872 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.62 
 
 
2807 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22.59 
 
 
685 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  22.59 
 
 
685 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.33 
 
 
590 aa  67.4  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  28.57 
 
 
646 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  23.36 
 
 
878 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  22.54 
 
 
681 aa  64.7  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.48 
 
 
1126 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  26.78 
 
 
566 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.78 
 
 
526 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  23.93 
 
 
521 aa  62  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.46 
 
 
1040 aa  61.6  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.06 
 
 
1019 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  24.49 
 
 
664 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  26.94 
 
 
645 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.23 
 
 
573 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.1 
 
 
8871 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.11 
 
 
11716 aa  57  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.92 
 
 
655 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  25.7 
 
 
668 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.46 
 
 
604 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  25.5 
 
 
730 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  26.71 
 
 
4379 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  28.66 
 
 
1490 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30 
 
 
685 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.75 
 
 
3197 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26 
 
 
1275 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 
1138 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  31.05 
 
 
1133 aa  51.6  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  25.38 
 
 
829 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  26.16 
 
 
768 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  25.18 
 
 
758 aa  50.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.08 
 
 
447 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  27.24 
 
 
412 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.84 
 
 
616 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  27.62 
 
 
828 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>