25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1941 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1512    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  58.78 
 
 		 768 aa  731    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  43.2 
 
 		 708 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  37.11 
 
 		 776 aa  296  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1757  FG-GAP repeat-containing protein  35.84 
 
 		 730 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000292234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1221  FG-GAP repeat-containing protein  37.63 
 
 		 779 aa  213  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000316782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.12 
 
 		 8871 aa  187  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  29.11 
 
 		 2000 aa  90.9  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0323  hypothetical protein  29.57 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0332  hypothetical protein  24.62 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  23.98 
 
 		 604 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  23.76 
 
 		 593 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.74 
 
 		 1189 aa  51.2  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16659  predicted protein  25.11 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.97 
 
 		 1225 aa  47.4  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.6 
 
 		 1114 aa  47.8  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  24.88 
 
 		 499 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.16 
 
 		 1838 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.14 
 
 		 596 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.29 
 
 		 691 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  29.45 
 
 		 1129 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4333  FG-GAP repeat protein  25.63 
 
 		 758 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00966426  normal  0.30257 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 1282 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  37.86 
 
 		 574 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.83 
 
 		 1236 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>