34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1753 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 768 aa  1509    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  58.78 
 
 		 758 aa  717    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  43.55 
 
 		 708 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  39.33 
 
 		 776 aa  330  8e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1757  FG-GAP repeat-containing protein  39.07 
 
 		 730 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000292234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1221  FG-GAP repeat-containing protein  39.78 
 
 		 779 aa  233  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000316782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.52 
 
 		 8871 aa  185  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  32.89 
 
 		 2000 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0323  hypothetical protein  30.08 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.86 
 
 		 604 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.19 
 
 		 569 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.52 
 
 		 1114 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.5 
 
 		 1228 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.5 
 
 		 1246 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.3 
 
 		 1208 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0332  hypothetical protein  23.12 
 
 		 580 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  23.79 
 
 		 639 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.83 
 
 		 1161 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.18 
 
 		 1127 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.61 
 
 		 1236 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 		 1282 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  25.83 
 
 		 1113 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.66 
 
 		 1120 aa  47.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  24.89 
 
 		 1208 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4333  FG-GAP repeat protein  26.18 
 
 		 758 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00966426  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.51 
 
 		 593 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.27 
 
 		 1225 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.73 
 
 		 1129 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.85 
 
 		 593 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.63 
 
 		 1170 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  29.73 
 
 		 691 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  24.22 
 
 		 437 aa  45.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  24.64 
 
 		 499 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  22.71 
 
 		 402 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>