32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1756 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 708 aa  1396    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  43.55 
 
 		 768 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  43.64 
 
 		 758 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  37.15 
 
 		 776 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1757  FG-GAP repeat-containing protein  38.34 
 
 		 730 aa  265  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000292234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1221  FG-GAP repeat-containing protein  38.38 
 
 		 779 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000316782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.31 
 
 		 8871 aa  188  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  35.18 
 
 		 2000 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0323  hypothetical protein  31 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  26.07 
 
 		 499 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4333  FG-GAP repeat protein  25.27 
 
 		 758 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00966426  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  26.77 
 
 		 681 aa  54.3  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.58 
 
 		 1114 aa  52  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16659  predicted protein  24.3 
 
 		 742 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 1282 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.49 
 
 		 1838 aa  51.2  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1575 aa  51.2  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  29.84 
 
 		 655 aa  50.8  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0332  hypothetical protein  24.84 
 
 		 580 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.85 
 
 		 1189 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  23.12 
 
 		 1109 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  22.83 
 
 		 593 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2761  FG-GAP repeat protein  24.12 
 
 		 694 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  23.58 
 
 		 604 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.49 
 
 		 1170 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  26.29 
 
 		 524 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  28.82 
 
 		 1088 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  24.03 
 
 		 433 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3715  FG-GAP repeat-containing protein  22.04 
 
 		 514 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6179  peptidase M12A astacin  24.01 
 
 		 615 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0299292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  23.83 
 
 		 402 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  27.63 
 
 		 1203 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>