23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1754 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 776 aa  1523    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  39.95 
 
 		 768 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1757  FG-GAP repeat-containing protein  42.71 
 
 		 730 aa  347  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000292234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  37.11 
 
 		 758 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  36.27 
 
 		 708 aa  246  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  31.58 
 
 		 8871 aa  188  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1221  FG-GAP repeat-containing protein  32.84 
 
 		 779 aa  163  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000316782  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  34.11 
 
 		 2000 aa  81.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0323  hypothetical protein  29.17 
 
 		 503 aa  67.4  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  24.6 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4333  FG-GAP repeat protein  26.54 
 
 		 758 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00966426  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.59 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.94 
 
 		 1838 aa  50.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  24.11 
 
 		 499 aa  50.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16659  predicted protein  28.26 
 
 		 742 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  24.69 
 
 		 593 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 		 1282 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3320  FG-GAP repeat-containing protein  25.9 
 
 		 529 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.04 
 
 		 1228 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2761  FG-GAP repeat protein  25.7 
 
 		 694 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01580  conserved expressed protein  25 
 
 		 690 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  24.56 
 
 		 1348 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  25.5 
 
 		 438 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>