22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1655 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 389 aa  799    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  60.17 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  34.99 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  32.68 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  30.87 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  28.36 
 
 		 895 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  25.97 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.94 
 
 		 1838 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3929  FG-GAP repeat protein  26.59 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.21 
 
 		 2807 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  24.68 
 
 		 494 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  23.5 
 
 		 776 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.46 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  25.93 
 
 		 974 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2753  FG-GAP repeat-containing protein  27.82 
 
 		 797 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.1 
 
 		 1490 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.34 
 
 		 1127 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.32 
 
 		 1129 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  23.72 
 
 		 4379 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.3 
 
 		 1172 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  23.37 
 
 		 1527 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  23.47 
 
 		 616 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>