88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2320 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 
437 aa  903    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  57.49 
 
 
438 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  55.87 
 
 
435 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  53.16 
 
 
433 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  42.15 
 
 
437 aa  292  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  27.18 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  30.17 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  33.46 
 
 
510 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  29.68 
 
 
506 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  29.45 
 
 
524 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  33.33 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  27.39 
 
 
872 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  24.74 
 
 
1838 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  27.57 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  28.14 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  31.2 
 
 
1113 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.54 
 
 
1126 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27 
 
 
1340 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.57 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.09 
 
 
1019 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  27.64 
 
 
590 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  25.63 
 
 
1275 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.26 
 
 
1557 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.36 
 
 
2807 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  27.03 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.74 
 
 
1113 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.93 
 
 
1490 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  27.5 
 
 
655 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.7 
 
 
1222 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  26.03 
 
 
616 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  28.12 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  29.32 
 
 
974 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  23.03 
 
 
554 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  21.78 
 
 
1009 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.9 
 
 
828 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.34 
 
 
891 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  25.32 
 
 
1126 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.24 
 
 
2194 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.46 
 
 
889 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.55 
 
 
546 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.54 
 
 
3197 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.07 
 
 
1208 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.09 
 
 
3197 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.15 
 
 
1225 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  30.43 
 
 
895 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  23.58 
 
 
604 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  25.59 
 
 
803 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  29.5 
 
 
1166 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  26.87 
 
 
456 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.24 
 
 
1118 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  24.35 
 
 
1124 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  32.18 
 
 
561 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
1127 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.55 
 
 
1289 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  28.14 
 
 
917 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.24 
 
 
1236 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.27 
 
 
1120 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  23.62 
 
 
1575 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  22.38 
 
 
1109 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.33 
 
 
11716 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.09 
 
 
1129 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.91 
 
 
1161 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  23.34 
 
 
604 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  30.51 
 
 
644 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  37.93 
 
 
1447 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 
829 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  37.93 
 
 
1446 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  30.68 
 
 
813 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.37 
 
 
1208 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.41 
 
 
1114 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  21.76 
 
 
573 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  24.27 
 
 
562 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.37 
 
 
1226 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.1 
 
 
585 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  23.48 
 
 
4379 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  27.48 
 
 
685 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  30.32 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.19 
 
 
574 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 
635 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  28.67 
 
 
566 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.2 
 
 
596 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  30.58 
 
 
1107 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  30.43 
 
 
720 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  28.06 
 
 
1088 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  22.35 
 
 
499 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.35 
 
 
574 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  21.43 
 
 
1127 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>