122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2893 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 566 aa  1137    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  81.03 
 
 		 573 aa  838    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.33 
 
 		 1129 aa  170  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.53 
 
 		 1236 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  28.2 
 
 		 1208 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.66 
 
 		 1170 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.06 
 
 		 1225 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.71 
 
 		 1246 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.24 
 
 		 1226 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.78 
 
 		 1228 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.02 
 
 		 1192 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.88 
 
 		 1109 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  27.95 
 
 		 1203 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  26.8 
 
 		 1127 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.71 
 
 		 1114 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.5 
 
 		 1088 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.65 
 
 		 1208 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.33 
 
 		 1189 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.3 
 
 		 1066 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.59 
 
 		 1120 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  24.86 
 
 		 1183 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.52 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  26.92 
 
 		 1098 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.93 
 
 		 1193 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.13 
 
 		 1172 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.1 
 
 		 1040 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.39 
 
 		 1098 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  25.93 
 
 		 1113 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  25.76 
 
 		 1126 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  25.5 
 
 		 1107 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.85 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.04 
 
 		 649 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.37 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  27.08 
 
 		 573 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  25.95 
 
 		 556 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.28 
 
 		 593 aa  100  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  28.39 
 
 		 604 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  24.67 
 
 		 1166 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.68 
 
 		 600 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.45 
 
 		 604 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.43 
 
 		 554 aa  87.8  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.98 
 
 		 521 aa  87.4  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.41 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  28.22 
 
 		 1161 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.05 
 
 		 803 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  25.14 
 
 		 583 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.95 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  23.71 
 
 		 569 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  27.4 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.58 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  23.62 
 
 		 951 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.91 
 
 		 737 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  24.25 
 
 		 577 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.84 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  23.56 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.13 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.21 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.58 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  28.46 
 
 		 616 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.32 
 
 		 3197 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.59 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.05 
 
 		 3197 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.21 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.41 
 
 		 1838 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.65 
 
 		 691 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  23.62 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.58 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  24.6 
 
 		 872 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.23 
 
 		 1019 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.11 
 
 		 2807 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.04 
 
 		 828 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  23.37 
 
 		 667 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.12 
 
 		 8871 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.35 
 
 		 1557 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.16 
 
 		 1275 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  30.19 
 
 		 664 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.2 
 
 		 668 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  23.91 
 
 		 620 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  25.35 
 
 		 404 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.37 
 
 		 585 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  31.76 
 
 		 574 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1575 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.52 
 
 		 2194 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  28.71 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.89 
 
 		 1225 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.55 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  23.08 
 
 		 646 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.61 
 
 		 11716 aa  51.6  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  29.15 
 
 		 878 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  24.17 
 
 		 758 aa  50.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  23.1 
 
 		 1490 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  28.27 
 
 		 438 aa  50.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  26.89 
 
 		 433 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  23.53 
 
 		 655 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.98 
 
 		 730 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  21.6 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.05 
 
 		 447 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.42 
 
 		 1340 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  27.27 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>