65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0746 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  100 
 
 
681 aa  1402    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  31.66 
 
 
685 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  31.66 
 
 
685 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.42 
 
 
604 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  23.22 
 
 
556 aa  87.8  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.91 
 
 
1170 aa  87.4  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  24.22 
 
 
593 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.71 
 
 
1193 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.57 
 
 
1225 aa  81.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.7 
 
 
1246 aa  80.5  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.07 
 
 
1236 aa  80.5  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.11 
 
 
737 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  24.17 
 
 
593 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.43 
 
 
600 aa  77.4  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.51 
 
 
499 aa  77  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.48 
 
 
1228 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.77 
 
 
1114 aa  74.7  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.59 
 
 
1226 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.33 
 
 
1208 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  22.3 
 
 
573 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  24.57 
 
 
1575 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.12 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  36.36 
 
 
878 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.73 
 
 
1189 aa  70.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.2 
 
 
551 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
1127 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  23.61 
 
 
1120 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  23.5 
 
 
585 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  23.91 
 
 
569 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  28.99 
 
 
1183 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  36.96 
 
 
1109 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  27.59 
 
 
1088 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  23.9 
 
 
803 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  22.04 
 
 
1113 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  32.53 
 
 
655 aa  58.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  22.65 
 
 
649 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  19.88 
 
 
574 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  24.87 
 
 
1098 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.08 
 
 
1066 aa  54.3  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  22.51 
 
 
604 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  36.08 
 
 
1166 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  28.21 
 
 
1161 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.23 
 
 
1192 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  24.74 
 
 
1098 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
1184 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  23.34 
 
 
691 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  33.57 
 
 
1208 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  20.68 
 
 
577 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  22.61 
 
 
562 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  38.57 
 
 
1129 aa  50.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.87 
 
 
574 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  23.34 
 
 
1126 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.08 
 
 
1127 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  35.29 
 
 
1172 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  28.22 
 
 
506 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  31.18 
 
 
1107 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.42 
 
 
1203 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  20.33 
 
 
583 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.57 
 
 
453 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.71 
 
 
596 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.89 
 
 
585 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.47 
 
 
472 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  33.33 
 
 
521 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  22.86 
 
 
645 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  30.57 
 
 
1133 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>