97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00200 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  100 
 
 		 655 aa  1321    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1575 aa  114  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.23 
 
 		 803 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.17 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  29.36 
 
 		 593 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.58 
 
 		 649 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.35 
 
 		 546 aa  97.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  26.43 
 
 		 604 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.43 
 
 		 569 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  25.73 
 
 		 573 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  24.01 
 
 		 593 aa  89.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.08 
 
 		 453 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  32.63 
 
 		 878 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.61 
 
 		 1228 aa  84  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1127 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.61 
 
 		 583 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.88 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.07 
 
 		 1127 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  28.74 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.65 
 
 		 1189 aa  82  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.1 
 
 		 1170 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.81 
 
 		 551 aa  80.5  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.43 
 
 		 1236 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.73 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.62 
 
 		 1192 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.58 
 
 		 1246 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.73 
 
 		 1114 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.03 
 
 		 1088 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  24.8 
 
 		 1098 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  25.54 
 
 		 1183 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.81 
 
 		 1193 aa  74.3  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.81 
 
 		 1208 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.25 
 
 		 1109 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  26.32 
 
 		 1129 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  22.86 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.4 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  25.13 
 
 		 1166 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.27 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.29 
 
 		 1126 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  28.38 
 
 		 604 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.88 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.78 
 
 		 1040 aa  68.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.2 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.89 
 
 		 1226 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.24 
 
 		 1225 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  24.19 
 
 		 1208 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.29 
 
 		 1066 aa  64.7  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  24.31 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.62 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  28.63 
 
 		 1161 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  24.72 
 
 		 1098 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  23.45 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  22.89 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  26.32 
 
 		 1203 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  20.77 
 
 		 1107 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  22.89 
 
 		 685 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  27.62 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  32.53 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.5 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1184 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.06 
 
 		 1275 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.62 
 
 		 8871 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.76 
 
 		 872 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  22.54 
 
 		 1172 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.22 
 
 		 1113 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  25.63 
 
 		 1120 aa  53.9  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  26.95 
 
 		 3197 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  35.62 
 
 		 613 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  36.11 
 
 		 1441 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.94 
 
 		 585 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.99 
 
 		 604 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  34.44 
 
 		 726 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  26.37 
 
 		 887 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47159  predicted protein  32.76 
 
 		 1633 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0929677  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48735  predicted protein  35.42 
 
 		 820 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.60554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  23.53 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  32.97 
 
 		 2239 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.67 
 
 		 1126 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  28.92 
 
 		 545 aa  47.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  31.78 
 
 		 356 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.36 
 
 		 472 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  35.23 
 
 		 483 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.31 
 
 		 521 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3385  FG-GAP repeat-containing protein  28.23 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  24.28 
 
 		 951 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  30 
 
 		 669 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05425  hypothetical protein  40.38 
 
 		 316 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.03 
 
 		 573 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  25.51 
 
 		 469 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  26.37 
 
 		 406 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  27.27 
 
 		 1118 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1414 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1024 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  23.57 
 
 		 574 aa  44.3  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.18 
 
 		 2807 aa  43.9  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.52 
 
 		 929 aa  43.9  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  23.04 
 
 		 749 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>