180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1387 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  100 
 
 		 1490 aa  2924    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  46.61 
 
 		 604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.04 
 
 		 974 aa  241  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.38 
 
 		 1275 aa  226  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.64 
 
 		 1340 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.94 
 
 		 1113 aa  179  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.88 
 
 		 1222 aa  179  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.12 
 
 		 1225 aa  175  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.66 
 
 		 1019 aa  173  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  39.14 
 
 		 2807 aa  172  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.34 
 
 		 2194 aa  171  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.83 
 
 		 1118 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  40.88 
 
 		 1126 aa  169  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  37.14 
 
 		 1838 aa  164  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.78 
 
 		 889 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  36.58 
 
 		 1557 aa  152  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.33 
 
 		 891 aa  151  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.33 
 
 		 1009 aa  146  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  36 
 
 		 828 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.33 
 
 		 813 aa  126  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1638 aa  125  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  32.81 
 
 		 1124 aa  126  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.15 
 
 		 1012 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 872 aa  123  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  31.77 
 
 		 6272 aa  118  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  35.65 
 
 		 386 aa  115  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  31.71 
 
 		 554 aa  114  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  31.36 
 
 		 469 aa  112  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.73 
 
 		 616 aa  111  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  29.69 
 
 		 4379 aa  109  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  32.72 
 
 		 412 aa  109  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.52 
 
 		 3197 aa  108  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1289 aa  107  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.73 
 
 		 3197 aa  98.6  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  32.46 
 
 		 494 aa  97.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  29.72 
 
 		 472 aa  97.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  28.32 
 
 		 485 aa  94.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  30.83 
 
 		 657 aa  92.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  27.63 
 
 		 644 aa  85.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  28.05 
 
 		 685 aa  82.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  33.45 
 
 		 663 aa  74.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 1127 aa  73.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  25.36 
 
 		 917 aa  73.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  27.35 
 
 		 562 aa  72  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  28.12 
 
 		 447 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  31.4 
 
 		 720 aa  70.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 		 621 aa  70.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  27.45 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.07 
 
 		 959 aa  69.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 		 1154 aa  69.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  33.67 
 
 		 837 aa  67.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  31.17 
 
 		 803 aa  66.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  30.07 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.99 
 
 		 737 aa  65.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  34.42 
 
 		 1241 aa  65.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.37 
 
 		 569 aa  64.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  27.45 
 
 		 463 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  28.43 
 
 		 433 aa  63.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  28.36 
 
 		 1113 aa  63.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.34 
 
 		 1109 aa  63.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.38 
 
 		 1120 aa  62.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.51 
 
 		 1114 aa  62.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  32.29 
 
 		 791 aa  62  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  62  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.19 
 
 		 1226 aa  61.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1009 aa  61.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  31.11 
 
 		 437 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.86 
 
 		 1127 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.33 
 
 		 1236 aa  60.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.01 
 
 		 649 aa  59.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.93 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  25.66 
 
 		 662 aa  59.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.93 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.67 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  26.67 
 
 		 829 aa  58.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  29.8 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  25.82 
 
 		 1527 aa  58.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  30.2 
 
 		 3193 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  25.23 
 
 		 912 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.32 
 
 		 1193 aa  58.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.27 
 
 		 1208 aa  57.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.1 
 
 		 1192 aa  58.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  25.07 
 
 		 404 aa  57.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  25.75 
 
 		 895 aa  57.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  25.71 
 
 		 1098 aa  57.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  25.88 
 
 		 1126 aa  57.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.87 
 
 		 1228 aa  57.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  28.7 
 
 		 409 aa  56.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.72 
 
 		 593 aa  56.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  24.93 
 
 		 2497 aa  57  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  33.33 
 
 		 1245 aa  56.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  30.34 
 
 		 577 aa  57  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  27.49 
 
 		 524 aa  57  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 525 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.86 
 
 		 1066 aa  56.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.97 
 
 		 11716 aa  56.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 		 635 aa  56.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  26.55 
 
 		 438 aa  56.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 		 1172 aa  56.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  29.74 
 
 		 760 aa  55.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>