115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2038 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  100 
 
 		 690 aa  1383    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  69.65 
 
 		 3193 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  68.33 
 
 		 940 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  60.84 
 
 		 3041 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  70.4 
 
 		 833 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  56.23 
 
 		 912 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.21 
 
 		 1154 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.79 
 
 		 1372 aa  303  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  38.91 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 760 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  29.87 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  35.94 
 
 		 1308 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  30.35 
 
 		 688 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  31.84 
 
 		 828 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  28.48 
 
 		 861 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  34.98 
 
 		 417 aa  113  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  34.52 
 
 		 409 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.83 
 
 		 9867 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  29.74 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  32.8 
 
 		 974 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  32.35 
 
 		 337 aa  95.5  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.65 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  28.08 
 
 		 604 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.31 
 
 		 1094 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  38.79 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  27.53 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  34.29 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29.09 
 
 		 1275 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  30.07 
 
 		 1490 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  26.69 
 
 		 883 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.41 
 
 		 1126 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.7 
 
 		 1113 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  21.89 
 
 		 868 aa  63.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6119  hypothetical protein  36.79 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6118  hypothetical protein  37.72 
 
 		 393 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  27.9 
 
 		 1201 aa  61.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1289 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.08 
 
 		 1225 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.61 
 
 		 2816 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.71 
 
 		 1019 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.47 
 
 		 1222 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  29.08 
 
 		 813 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  35.59 
 
 		 3477 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  26.22 
 
 		 2497 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  33.98 
 
 		 209 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.8 
 
 		 2194 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  25.53 
 
 		 1348 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  29.19 
 
 		 293 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.72 
 
 		 1340 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03150  hypothetical protein  35.25 
 
 		 690 aa  55.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.04 
 
 		 4978 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.95 
 
 		 213 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  33.96 
 
 		 465 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.16 
 
 		 443 aa  54.3  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  30.88 
 
 		 310 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  29.41 
 
 		 1557 aa  53.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.44 
 
 		 959 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.02 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  32.99 
 
 		 458 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.5 
 
 		 2377 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  33.91 
 
 		 1131 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  35.71 
 
 		 744 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.06 
 
 		 3474 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  30.33 
 
 		 450 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  26.87 
 
 		 514 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  28.57 
 
 		 293 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  33.01 
 
 		 167 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  33.96 
 
 		 1394 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.31 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.18 
 
 		 1118 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  29.77 
 
 		 1131 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  27.45 
 
 		 541 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.5 
 
 		 889 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2897  SCP-like extracellular  27.88 
 
 		 279 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204847  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.85 
 
 		 206 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  31.43 
 
 		 212 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1623  SCP-like extracellular  27.52 
 
 		 259 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.015038  hitchhiker  0.000000394389 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1538 aa  50.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  32.52 
 
 		 658 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  25.28 
 
 		 811 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.9 
 
 		 129 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  26.09 
 
 		 456 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  31.31 
 
 		 196 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  22.77 
 
 		 2064 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  27.5 
 
 		 649 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  26.32 
 
 		 917 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  36.27 
 
 		 282 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  24.11 
 
 		 2513 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.14 
 
 		 872 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  31.31 
 
 		 258 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  35.45 
 
 		 1032 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  30.08 
 
 		 305 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.45 
 
 		 3191 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  29.2 
 
 		 200 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  28.65 
 
 		 399 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  45 
 
 		 286 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.77 
 
 		 1346 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 		 635 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>