198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2649 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  77.62 
 
 		 310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  61.87 
 
 		 286 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  61.57 
 
 		 288 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  46.59 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  46.05 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  45.07 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.68 
 
 		 279 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  47.31 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  45.49 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  44.12 
 
 		 283 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  43.75 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  45.95 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  43.38 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  45.88 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  47.1 
 
 		 162 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  41.86 
 
 		 179 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  49.21 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  37.88 
 
 		 200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  44.78 
 
 		 222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  43.41 
 
 		 206 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  40.14 
 
 		 157 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  47.66 
 
 		 495 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  45.28 
 
 		 212 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.37 
 
 		 213 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  40.74 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  46.09 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  45.37 
 
 		 209 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  39.26 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  43.4 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  35.38 
 
 		 167 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  42.11 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  34.72 
 
 		 541 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  44.88 
 
 		 211 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  44.34 
 
 		 180 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  38.35 
 
 		 200 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  42.99 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.3 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  43.52 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  40.95 
 
 		 222 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.62 
 
 		 444 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  36.84 
 
 		 249 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  41.41 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  36.64 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  44.76 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  41.35 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  41.22 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  42.31 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.06 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  38.64 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  34.31 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  32.64 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  38.68 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  35.64 
 
 		 196 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  39.36 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  34.86 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  36.54 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  32.12 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  31.1 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  30.49 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  31.1 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  30.49 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  30.49 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  30.49 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  30.49 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  36 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  36.54 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  34.07 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  29.88 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  34.62 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 551 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  35.96 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  44.79 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  33.85 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  35.19 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.19 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  37.04 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  33.64 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  39.42 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  34.62 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  40.66 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  31.43 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  40.66 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  39.56 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  38.38 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35.66 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  39.36 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  39.56 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  39.56 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  39.56 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  39.56 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  39.56 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  39.56 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  32.56 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  29.46 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.22 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  38.37 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>