174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3579 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  84.98 
 
 		 293 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  70.55 
 
 		 294 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  66.67 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  65.53 
 
 		 283 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  66.55 
 
 		 283 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  73.12 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  67.49 
 
 		 279 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  65.19 
 
 		 283 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  64.95 
 
 		 301 aa  387  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  73.12 
 
 		 282 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  48.91 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  46.85 
 
 		 288 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  47.47 
 
 		 310 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  46.27 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  45.39 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  46.27 
 
 		 162 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  48.48 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  43.41 
 
 		 200 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  38.52 
 
 		 179 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  42.11 
 
 		 222 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  39.86 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  43.94 
 
 		 211 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  37.69 
 
 		 157 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  45.53 
 
 		 222 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  36.84 
 
 		 167 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  36.42 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  38.1 
 
 		 180 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.11 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  39.16 
 
 		 338 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  40.74 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  40.3 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  41.98 
 
 		 495 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  39.5 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  36.57 
 
 		 541 aa  89.4  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  41.82 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  38.52 
 
 		 500 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.04 
 
 		 444 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  47.06 
 
 		 317 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  36.96 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  36.96 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  38.26 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  35.07 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  42.34 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.61 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  37.88 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  36.92 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  40.18 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  31.65 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  32.85 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.24 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  35.51 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  33.58 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  40 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  33.58 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  34.03 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  35.56 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  38.71 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.1 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  32.84 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  32.84 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  32.84 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  32.84 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  32.84 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  32.84 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  32.84 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  32.84 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  31.82 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  31.82 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  32.17 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  34.55 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  34.65 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  38.71 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  31.17 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  39.39 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  30.5 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  29.32 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.4 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2434  SCP-like extracellular  35.83 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  35.34 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  33.59 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  34.85 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.79 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  35.09 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 551 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  34.51 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  35.09 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  29.82 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  35.46 
 
 		 833 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  35.42 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2897  SCP-like extracellular  31.4 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204847  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  29.93 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  33.58 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  34.29 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  28.36 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  29.75 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  34.21 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  34.21 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  34.21 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>