174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2358 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  100 
 
 		 283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  96.11 
 
 		 283 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  95.41 
 
 		 283 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  92.23 
 
 		 283 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  69.06 
 
 		 293 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  69.26 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  70.61 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  68.42 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  71.65 
 
 		 282 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  67.65 
 
 		 279 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  72.05 
 
 		 282 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  48.44 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  45.53 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  44.09 
 
 		 288 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  45.53 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  44 
 
 		 206 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  41.13 
 
 		 162 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  46.21 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  36.64 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.7 
 
 		 213 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  37.78 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  36.57 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  36.09 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  44.95 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  37.16 
 
 		 200 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  45.28 
 
 		 211 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  43.93 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  44.44 
 
 		 222 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  40.91 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  38.06 
 
 		 495 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  40.44 
 
 		 331 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  41.75 
 
 		 180 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  36.96 
 
 		 159 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  40.95 
 
 		 167 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  40.91 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  33.76 
 
 		 347 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  39.29 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  37.14 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  35.29 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  39.62 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.11 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  37.69 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  40 
 
 		 500 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  37.12 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  36.11 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.22 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  35.64 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  37.78 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  31.69 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  36.11 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  36.11 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  36.11 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  36.11 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  36.11 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  36.11 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  31.16 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  36.11 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  37.27 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  38.89 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  36.11 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  35.85 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  31.65 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  35.19 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  39.09 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  33.02 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  34.26 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  34.41 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  31.21 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  33.09 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.41 
 
 		 443 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  33.57 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2434  SCP-like extracellular  38.04 
 
 		 157 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  34.65 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  38.64 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  35.14 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  29.23 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  34.07 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  33.63 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  37.63 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  31.2 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  32.73 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  38.37 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.19 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  37.5 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  34.09 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  34.55 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  30.91 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  29.55 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2745  allergen V5/TPX-1 family protein  35.24 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  37.36 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  38.46 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.25 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>