188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2424 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  100 
 
 
200 aa  407  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  39.71 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  42.14 
 
 
282 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  44.19 
 
 
299 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  37.87 
 
 
206 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  40.74 
 
 
200 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  40.43 
 
 
293 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  40.29 
 
 
286 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  38.3 
 
 
293 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  41.73 
 
 
288 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  48.57 
 
 
338 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  38.81 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  43.18 
 
 
296 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  37.16 
 
 
283 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  41.79 
 
 
310 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  39.69 
 
 
294 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  42.14 
 
 
282 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  37.16 
 
 
283 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  38.57 
 
 
301 aa  94.7  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  34.88 
 
 
157 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  40.15 
 
 
162 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  36.3 
 
 
283 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  38.3 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.41 
 
 
279 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  36.99 
 
 
283 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  31.49 
 
 
276 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  38.35 
 
 
320 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  37.96 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  44.66 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  45.28 
 
 
317 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  41.3 
 
 
331 aa  89.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  42.59 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  31.87 
 
 
270 aa  87.8  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  31.87 
 
 
270 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  41.18 
 
 
283 aa  87.8  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  42.16 
 
 
275 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  34.38 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  42.16 
 
 
275 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  42.16 
 
 
263 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  42.16 
 
 
275 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  42.16 
 
 
275 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  37.69 
 
 
180 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  37.86 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  42.16 
 
 
275 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  42.16 
 
 
275 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  40.48 
 
 
285 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  31.18 
 
 
328 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  34.85 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  35.88 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.42 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.59 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  39.62 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  39.39 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  41.35 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  38.64 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  39.39 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  34.38 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  37.76 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  39.84 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  40.95 
 
 
495 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  40.59 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  33.59 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  37.3 
 
 
226 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  37.14 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  35.07 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.46 
 
 
443 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.12 
 
 
300 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  31.88 
 
 
317 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  31.88 
 
 
317 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  39.25 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.58 
 
 
129 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  30.83 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  42.16 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  35.25 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  39.22 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  38.71 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  44.74 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  37.89 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  38.68 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.96 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  41.86 
 
 
500 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  40.59 
 
 
287 aa  68.2  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  29.75 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  33.55 
 
 
352 aa  67.8  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  30.3 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.51 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  35.61 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  32.35 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  33.97 
 
 
423 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  39.36 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  35.25 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  32.21 
 
 
337 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  36.11 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  31.93 
 
 
355 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1623  SCP-like extracellular  31.62 
 
 
259 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.015038  hitchhiker  0.000000394389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  33.64 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.64 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  32.59 
 
 
156 aa  62  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.96 
 
 
322 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  39.74 
 
 
287 aa  62  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>