177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001041 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  50.38 
 
 
200 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  41.57 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  41.86 
 
 
320 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  39.26 
 
 
293 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  43.61 
 
 
299 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  41.09 
 
 
310 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  38.52 
 
 
293 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  38.61 
 
 
222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.93 
 
 
279 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  39.69 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  38.17 
 
 
283 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  37.4 
 
 
283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  37.4 
 
 
282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  36.64 
 
 
283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  35.11 
 
 
294 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  38.06 
 
 
288 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  36.64 
 
 
301 aa  104  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  37.4 
 
 
286 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  37.31 
 
 
465 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  48.62 
 
 
458 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.71 
 
 
444 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  41.43 
 
 
162 aa  101  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  46.3 
 
 
209 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  37.14 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  46.15 
 
 
338 aa  97.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 
331 aa  97.4  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.95 
 
 
213 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  35.77 
 
 
347 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  36.64 
 
 
282 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  38.81 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.1 
 
 
443 aa  95.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  33.53 
 
 
317 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  33.78 
 
 
157 aa  94.4  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  44.23 
 
 
338 aa  94  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  43.81 
 
 
222 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  40.57 
 
 
249 aa  92  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  42.45 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  39.81 
 
 
212 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  35.71 
 
 
260 aa  87.8  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  41.28 
 
 
211 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  40 
 
 
495 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  38.76 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  34.46 
 
 
541 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  35.53 
 
 
242 aa  82  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  33.77 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35.88 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  40.82 
 
 
226 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  37.86 
 
 
305 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  36.76 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  35.4 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  38.39 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.15 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  34.43 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  36.36 
 
 
287 aa  72  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  36.19 
 
 
296 aa  70.9  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  34.58 
 
 
283 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  36.45 
 
 
334 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  38.53 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  28.97 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  36.45 
 
 
500 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  26.55 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  29.63 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  32.71 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  32.71 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  32.71 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  32.71 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  32.71 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  31.3 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  32.71 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  32.71 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  32.71 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  32.71 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.65 
 
 
322 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  28.57 
 
 
328 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  28.68 
 
 
245 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  30.91 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  32.95 
 
 
450 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  30.66 
 
 
264 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  31.37 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  36.73 
 
 
232 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2897  SCP-like extracellular  30.91 
 
 
279 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204847  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  36.96 
 
 
410 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  33.81 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  32.35 
 
 
159 aa  60.8  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  25.79 
 
 
336 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  28.07 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.07 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.43 
 
 
300 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  29.91 
 
 
344 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  29.91 
 
 
344 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  30.3 
 
 
280 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  32.12 
 
 
335 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  28.36 
 
 
373 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  29.91 
 
 
353 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  35.63 
 
 
214 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.85 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
551 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  29.75 
 
 
341 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1235  Allergen V5/Tpx-1 related  41.94 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>