201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5005 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  100 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  63.11 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  63.64 
 
 
495 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  49.16 
 
 
305 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  52.38 
 
 
226 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  45.81 
 
 
211 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  48.91 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  57.5 
 
 
264 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  44.13 
 
 
232 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  54.1 
 
 
249 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  54.55 
 
 
212 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  52.5 
 
 
209 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  43.54 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  52.94 
 
 
287 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  40.98 
 
 
263 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  41.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  41.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  41.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  41.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  42.2 
 
 
270 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  42.2 
 
 
270 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.02 
 
 
213 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  47.45 
 
 
167 aa  121  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  40.64 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  42.11 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  42.11 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  43.88 
 
 
180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  52.54 
 
 
300 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  40.96 
 
 
465 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  49.6 
 
 
317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  46.72 
 
 
283 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  43.68 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  46.34 
 
 
285 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.94 
 
 
444 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.93 
 
 
300 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  38.1 
 
 
458 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  41.82 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  46.72 
 
 
255 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  41.91 
 
 
203 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  44 
 
 
244 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  45.08 
 
 
222 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  47.54 
 
 
500 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  46.28 
 
 
245 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  45.52 
 
 
299 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.95 
 
 
443 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  42.65 
 
 
205 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  36.14 
 
 
242 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  35.48 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  36.93 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  39.34 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  41.6 
 
 
541 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.46 
 
 
322 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  40.17 
 
 
347 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  39.53 
 
 
157 aa  89  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  34.44 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  35.19 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.34 
 
 
321 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  42.98 
 
 
450 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  35.34 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  30.33 
 
 
355 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  35.62 
 
 
399 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  43.69 
 
 
200 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  33.78 
 
 
423 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.34 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  41.27 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  37.8 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  42.72 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  44.76 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  30.64 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  34.23 
 
 
290 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  37.31 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  37.31 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  37.01 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  37.88 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  41.09 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  37.12 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  37.17 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  41.32 
 
 
410 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  34.72 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2897  SCP-like extracellular  33.05 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204847  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  44.44 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  37.12 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  37.12 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  34.03 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  34.92 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  43.14 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  36.36 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  35.65 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  37.19 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  37.19 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  37.19 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  35.71 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  36.42 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.6 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  37.19 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  37.19 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  37.19 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  36.53 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>