175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0309 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  85.61 
 
 		 160 aa  249  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  45.69 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  44.35 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  44.83 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  36.29 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  37.29 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  34.85 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  31.33 
 
 		 541 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  35.71 
 
 		 205 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  38.98 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  33.9 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.98 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  35.04 
 
 		 296 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  35.61 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  37.1 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  35.71 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  39.64 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  34.75 
 
 		 328 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  34.48 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  34.96 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.59 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  35.59 
 
 		 338 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  34.48 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  35.29 
 
 		 264 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  32.71 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  37.86 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  31.62 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  37.39 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  31.15 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 275 aa  62  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  33.87 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  32.2 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  35 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  35.19 
 
 		 331 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  29.91 
 
 		 211 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  38.24 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  30.25 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  35 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  35.71 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  35.29 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  37.38 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  35.29 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  34.51 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.41 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  35.29 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.9 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  36.63 
 
 		 495 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  36.73 
 
 		 285 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  41.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  34.75 
 
 		 465 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.04 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  32.2 
 
 		 222 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  31.36 
 
 		 212 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  32.35 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  34.31 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  30.51 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  32.35 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  40 
 
 		 410 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  31.36 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  32.32 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  31.25 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  31.78 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  33.87 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  33.05 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  32.5 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  33.67 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  34.34 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  34.07 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  35.35 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  33.57 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  32.71 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 458 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.01 
 
 		 444 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  32.2 
 
 		 287 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  37.07 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  29.2 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  35.66 
 
 		 353 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  27.5 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  41.07 
 
 		 293 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.29 
 
 		 602 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  35.71 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.48 
 
 		 213 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  39.29 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  30.51 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  34.95 
 
 		 298 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2772  hypothetical protein  40.62 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  31.03 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  37.37 
 
 		 168 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>