113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0588 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  63.06 
 
 		 165 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  62.07 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  51.27 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  41.03 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  89  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  89  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.41 
 
 		 444 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  34.38 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  35.94 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  30.14 
 
 		 353 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  40.19 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  30.94 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  31.76 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  30.47 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  34.13 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  31.45 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.47 
 
 		 443 aa  58.2  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  31.54 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  30.87 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  34.45 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  27.08 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.91 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  30.53 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  31.97 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  32.79 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.79 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  35.59 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  33.63 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  30.4 
 
 		 373 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  36.52 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  30.53 
 
 		 347 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.64 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  28.8 
 
 		 336 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  35.25 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  29.41 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  28.71 
 
 		 260 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  32.77 
 
 		 300 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  31.85 
 
 		 450 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  30 
 
 		 242 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  34.83 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  34.23 
 
 		 305 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.68 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  32.03 
 
 		 317 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  28.74 
 
 		 171 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.85 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  32.31 
 
 		 312 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.97 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  30.71 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  28.21 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  31.75 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2400  SCP-like extracellular  28.67 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00828302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  27.56 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  28 
 
 		 344 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  29.92 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  27.73 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  29.84 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  27.94 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  26.92 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  27.15 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  31.93 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  30.17 
 
 		 270 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  30.17 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  30.17 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  29.1 
 
 		 263 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  30.83 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  30.17 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  31.61 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  29.66 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  30.17 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  30.17 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1117  SCP-like extracellular  28.06 
 
 		 351 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  30.17 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  30.17 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  30 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  26.36 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1146  SCP-like extracellular  33.96 
 
 		 351 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.582279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  29.06 
 
 		 232 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  30 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  29.68 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  30 
 
 		 169 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  27.89 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  30.53 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  27.97 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  29.17 
 
 		 541 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  31.15 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  29.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  30.77 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  26.77 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  29.79 
 
 		 282 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.57 
 
 		 322 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  29.31 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>