158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4689 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  100 
 
 		 171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  84.21 
 
 		 170 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  83.04 
 
 		 170 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  79.05 
 
 		 169 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  71.03 
 
 		 168 aa  217  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  75.16 
 
 		 171 aa  216  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  71.63 
 
 		 169 aa  214  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  56.03 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  43.48 
 
 		 169 aa  131  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  50 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  47.02 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  50 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  47.83 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  52.52 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  52.45 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  42.67 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  40.4 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  38.41 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  35.85 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  44.44 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  35.85 
 
 		 193 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  37.69 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  38.17 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  33.77 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.4 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  37.29 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  32.86 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  37.6 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  31.97 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.97 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  35.16 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  36.94 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  34.92 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.94 
 
 		 322 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  39.5 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  35.34 
 
 		 338 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  36.52 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  31.36 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  32.2 
 
 		 541 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  34.06 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  34.45 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.45 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  34.55 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.01 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  31.21 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  33.87 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  31.3 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  30.17 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  30.47 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  31.25 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 551 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  31.3 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  32.74 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  31.37 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  31.2 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  33.62 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  31.67 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  36.52 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  30.56 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  31.62 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  29.63 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  30.52 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  29.41 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  32.65 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  32.43 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  29.41 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  31.48 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  30.36 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  29.31 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  28.12 
 
 		 264 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  27.62 
 
 		 294 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  30.84 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  27.78 
 
 		 283 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  32.41 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  28.81 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  32.63 
 
 		 263 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  32.63 
 
 		 270 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  27.78 
 
 		 283 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  32.63 
 
 		 275 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  32.63 
 
 		 275 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  32.63 
 
 		 275 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  32.63 
 
 		 275 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  32.63 
 
 		 275 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  31 
 
 		 244 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  32.63 
 
 		 275 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  32.63 
 
 		 270 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  31.09 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  26.67 
 
 		 242 aa  51.2  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  29.81 
 
 		 188 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 276 aa  50.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  31.31 
 
 		 260 aa  50.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  35.83 
 
 		 334 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  32.63 
 
 		 237 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  30.19 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  28.71 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  30.12 
 
 		 282 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  29.75 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  29.17 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>