152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0934 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 
353 aa  687    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  63.92 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  40.37 
 
 
270 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  43.85 
 
 
249 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  38.89 
 
 
211 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  37.32 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  39.23 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  40.8 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  40.29 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  36.72 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  31.74 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  42.19 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.28 
 
 
444 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  31.14 
 
 
184 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  38.46 
 
 
209 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  40 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  38.52 
 
 
205 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  39.68 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.16 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  42.19 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  35.71 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.46 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  38.17 
 
 
541 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.71 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  34.88 
 
 
465 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  39.23 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  35.61 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  29.6 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  37.01 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  30.71 
 
 
176 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  37.01 
 
 
276 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  37.01 
 
 
275 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  37.01 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  37.01 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  37.01 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  37.01 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  37.01 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  37.01 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  37.01 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  32.39 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  37.01 
 
 
263 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  36.51 
 
 
287 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  35.66 
 
 
226 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  34.38 
 
 
264 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  32.31 
 
 
222 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  35 
 
 
164 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
165 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  37.61 
 
 
244 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  37.14 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
165 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.76 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  30.28 
 
 
189 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  34.51 
 
 
254 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  36.3 
 
 
156 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.3 
 
 
156 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  38.76 
 
 
212 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  36.07 
 
 
197 aa  62.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4541  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.22 
 
 
150 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  35.77 
 
 
182 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  38.74 
 
 
222 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  37.84 
 
 
200 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
168 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.84 
 
 
300 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  33.87 
 
 
171 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  37.17 
 
 
450 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  30.15 
 
 
341 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  30.83 
 
 
287 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  30.83 
 
 
287 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  35.11 
 
 
167 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  35.94 
 
 
495 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  36.52 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  33.06 
 
 
170 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.06 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0344  SCP-like extracellular  25.79 
 
 
152 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00450711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  34.53 
 
 
200 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  32.26 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  33.08 
 
 
276 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  31.25 
 
 
174 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2897  SCP-like extracellular  38.02 
 
 
279 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204847  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  33.6 
 
 
193 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  36.78 
 
 
338 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  32.26 
 
 
171 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  31.97 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  33.6 
 
 
162 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  35.77 
 
 
161 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  35.62 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  30.16 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  29.93 
 
 
500 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  32.52 
 
 
162 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  31.45 
 
 
170 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  30.77 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  30.77 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
167 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0893  Allergen V5/Tpx-1 related  33.06 
 
 
449 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.087721 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  35.24 
 
 
179 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  33.85 
 
 
194 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  30.77 
 
 
264 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  33.87 
 
 
196 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  28.35 
 
 
220 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>