116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6058 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  58.6 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  51.47 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  53.8 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  51.9 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  47.83 
 
 		 141 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  42.11 
 
 		 162 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  42.86 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  37.59 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  41.59 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  37.93 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  41.74 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  36 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  33.59 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  35.88 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  34.35 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  35.88 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  37.93 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  33.06 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  31.62 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  39.66 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  34.01 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  33.91 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  34.75 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  36.8 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  36.8 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  30.23 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.48 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  36.27 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  35.48 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  30.17 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  36.21 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  36.52 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  36.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  33.91 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0460  SCP-like extracellular  37.5 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.133435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  33.05 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  29.92 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  39.66 
 
 		 338 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.93 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  35.65 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  33.7 
 
 		 541 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  28.48 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  32.67 
 
 		 320 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.91 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  29.23 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  36.45 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  30.77 
 
 		 294 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  30.68 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.9 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.86 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2853  SCP-like extracellular  31.82 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  32.67 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  32.35 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  33.33 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  30 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  35.29 
 
 		 282 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1260  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.43 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4541  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.09 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  26.8 
 
 		 347 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  31.82 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  36.26 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  39.02 
 
 		 410 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  34.58 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2451  SCP-like extracellular  45.1 
 
 		 384 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.645872  normal  0.0150957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  32.71 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  34.65 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  22.6 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  34.34 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.34 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  25.87 
 
 		 457 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  30 
 
 		 280 aa  45.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  43.1 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  32.29 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1235  Allergen V5/Tpx-1 related  35.82 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.57 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.21 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.31 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.35 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0710  putative lipoprotein  22.9 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  31.3 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  34.62 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  34.62 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  34.62 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  21.47 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  34.62 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  42.59 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  33.72 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  31.3 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  28.07 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  34.62 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  30 
 
 		 349 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  32 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  37.29 
 
 		 589 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>