88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2451 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2451  SCP-like extracellular  100 
 
 
384 aa  758    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.645872  normal  0.0150957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.93 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  35.25 
 
 
214 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  32.87 
 
 
235 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  34.11 
 
 
203 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  38.21 
 
 
237 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  32.56 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  33.07 
 
 
242 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.73 
 
 
372 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  35.56 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  29.88 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  29.73 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  33.96 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.45 
 
 
129 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  34.68 
 
 
211 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  33.6 
 
 
349 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.45 
 
 
461 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0131  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
206 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0989282  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  31.08 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  29.92 
 
 
167 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  29.85 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  29.85 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  29.85 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  29.85 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  29.85 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  31.41 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  29.85 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  32.85 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.34 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  29.85 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  32.48 
 
 
208 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  27.78 
 
 
276 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.47 
 
 
568 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  29.1 
 
 
270 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  29.1 
 
 
270 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3865  SCP-like extracellular  25.9 
 
 
207 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  47.54 
 
 
205 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1117  SCP-like extracellular  24.74 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3665  SCP-like extracellular protein  28.92 
 
 
594 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.43 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  33.61 
 
 
212 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  27.98 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1146  SCP-like extracellular  24.23 
 
 
351 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.582279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  29.73 
 
 
249 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1334  hypothetical protein  38 
 
 
377 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  29.46 
 
 
305 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  54 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  28.36 
 
 
373 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.49 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
218 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.09 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  31.43 
 
 
338 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  28.99 
 
 
258 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  31.97 
 
 
246 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
160 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2400  SCP-like extracellular  35.09 
 
 
184 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00828302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  32.54 
 
 
495 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.5 
 
 
444 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  33 
 
 
203 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  31.01 
 
 
196 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  34.48 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  44.07 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4541  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.28 
 
 
150 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  42.55 
 
 
200 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  40 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2510  SCP-like extracellular  25 
 
 
181 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.55 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  28.39 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  29.58 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  45 
 
 
410 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  27.81 
 
 
209 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  32 
 
 
139 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  38.78 
 
 
162 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  27.61 
 
 
541 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  32 
 
 
139 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  26.7 
 
 
194 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  29.31 
 
 
337 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  28.57 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1913  Allergen V5/Tpx-1 related  25.93 
 
 
163 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  51.11 
 
 
589 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  29.75 
 
 
264 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  48.72 
 
 
300 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  25 
 
 
458 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2853  SCP-like extracellular  31.75 
 
 
179 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  31.76 
 
 
162 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  39.22 
 
 
524 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>