156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3066 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  38.57 
 
 
184 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  38.52 
 
 
184 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3798  SCP-like extracellular  46.22 
 
 
321 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4341  Allergen V5/Tpx-1 related  32.95 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135556  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1146  SCP-like extracellular  40.15 
 
 
351 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.582279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1913  Allergen V5/Tpx-1 related  40 
 
 
163 aa  92  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1117  SCP-like extracellular  40.15 
 
 
351 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2510  SCP-like extracellular  41.41 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  38.93 
 
 
264 aa  87.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4541  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.41 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  32.69 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  32.69 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  32.69 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  32.69 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  32.69 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1260  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.04 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  32.69 
 
 
275 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  32.69 
 
 
270 aa  72  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  32.69 
 
 
275 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  38.1 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  36.64 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  32.05 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  35.25 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  34.15 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  30.07 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.69 
 
 
328 aa  67  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  30.71 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.97 
 
 
372 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  31.82 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  31.87 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  35.29 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  32.77 
 
 
285 aa  64.7  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  31.45 
 
 
287 aa  64.3  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  28.03 
 
 
450 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  32 
 
 
226 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  31.39 
 
 
260 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  32.24 
 
 
423 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
495 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  33.57 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  33.57 
 
 
399 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.06 
 
 
213 aa  62  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  32.62 
 
 
196 aa  61.6  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  31.62 
 
 
300 aa  61.6  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  32.06 
 
 
347 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  33.87 
 
 
305 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  36.36 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  31.75 
 
 
242 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  31.5 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  33.87 
 
 
264 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  30.3 
 
 
188 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  34.27 
 
 
317 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  39.09 
 
 
160 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  31.78 
 
 
296 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.15 
 
 
209 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  30.23 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  32.33 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  36.54 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  35.09 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  30.2 
 
 
373 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  41.57 
 
 
139 aa  57.8  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  41.57 
 
 
139 aa  57.8  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  32 
 
 
280 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  31.75 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  35.54 
 
 
500 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  32.79 
 
 
245 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  28.07 
 
 
302 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  29.3 
 
 
410 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.79 
 
 
444 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  30.18 
 
 
465 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3665  SCP-like extracellular protein  32.14 
 
 
594 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  28.26 
 
 
353 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  32.28 
 
 
312 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  33.05 
 
 
541 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  32.46 
 
 
275 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  29.53 
 
 
344 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  28.86 
 
 
344 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  28.86 
 
 
344 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  31.3 
 
 
301 aa  54.3  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  28.86 
 
 
344 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  28.86 
 
 
344 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  28.86 
 
 
336 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  28.86 
 
 
344 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  28.86 
 
 
344 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  36.08 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  28.17 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  32.33 
 
 
317 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  32.33 
 
 
317 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.15 
 
 
300 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  28.86 
 
 
344 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3865  SCP-like extracellular  27.97 
 
 
207 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  34.91 
 
 
293 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  27.66 
 
 
336 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 
568 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  34 
 
 
287 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  34 
 
 
287 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1864  SCP-like extracellular  30.94 
 
 
335 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  30 
 
 
458 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0369  SCP-like extracellular  30.86 
 
 
570 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.879788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>