104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1020 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  100 
 
 		 162 aa  330  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  91.36 
 
 		 162 aa  303  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  91.36 
 
 		 193 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  72.54 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  68.46 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  72.09 
 
 		 161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  44.97 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  41.6 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  41.6 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  46.49 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  40.8 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  37.8 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  42.4 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  39.2 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  38.14 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  38.4 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  36 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  40 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  38.67 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  35.14 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  37.29 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  34.96 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  33.78 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  32.46 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  39.52 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  36.67 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.9 
 
 		 213 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  36.29 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.59 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  35.29 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  36 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  36.29 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  35.88 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  34.17 
 
 		 335 aa  63.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  35.59 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  32.46 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  30.65 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  30.23 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  30.58 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.63 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  31.93 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  32.52 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  28.36 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  35.45 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.15 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  32.2 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.2 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  31.51 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  25.66 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  29.09 
 
 		 310 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  28.93 
 
 		 280 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  29.2 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  30 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  30.13 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  27.01 
 
 		 255 aa  50.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  30.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.7 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  28.24 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  32.23 
 
 		 270 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  30.26 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.28 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  31.63 
 
 		 260 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.97 
 
 		 444 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  24.3 
 
 		 242 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  47.8  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0346  SCP-like extracellular  27.27 
 
 		 261 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  33.9 
 
 		 495 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.43 
 
 		 279 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  30 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  30.17 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.63 
 
 		 321 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  26.61 
 
 		 283 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.85 
 
 		 300 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0893  Allergen V5/Tpx-1 related  25.76 
 
 		 449 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.087721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  29.58 
 
 		 282 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  30.47 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  31.07 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.95 
 
 		 443 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  25.32 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1235  Allergen V5/Tpx-1 related  32.17 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  31.31 
 
 		 249 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  35.19 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  25.62 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  36 
 
 		 299 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  28.17 
 
 		 282 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  27.41 
 
 		 458 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  25.23 
 
 		 162 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  31.48 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  27.27 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  29.84 
 
 		 220 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  25.93 
 
 		 293 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  25.45 
 
 		 276 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  29.79 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  28.57 
 
 		 244 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  29.59 
 
 		 302 aa  41.2  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  27.4 
 
 		 206 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>