126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3184 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  57.33 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  56.16 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  51.47 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  54.07 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  47.01 
 
 		 141 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  36.59 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  37.4 
 
 		 169 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  38.46 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  40.17 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  35.54 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  37.39 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  35 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  35 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  42.37 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  39.13 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  40.68 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  34.96 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  32.8 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  37.29 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  38.26 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  34.13 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  36.75 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  32.5 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.19 
 
 		 178 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  33.93 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  38.39 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  31.3 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  33.01 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  36.04 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  33.61 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  34.23 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  31.67 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  33.05 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  32.03 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  27.05 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  34.23 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  37.61 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  37.61 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  37.39 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  31.25 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  34.82 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  34.29 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  35.59 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  32.2 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.95 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  30.95 
 
 		 541 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  36.36 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  38.38 
 
 		 495 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.16 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  31.09 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  32.61 
 
 		 160 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4541  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.76 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  33.33 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  33.67 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.67 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  31.3 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  28.91 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  28.91 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  28.91 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  28.91 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  28.91 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  28.91 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  28.91 
 
 		 263 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  28.91 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  29.21 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  31.53 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  31.3 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  32.14 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 		 322 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  29.41 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  28.12 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  30.97 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  35.4 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  27.91 
 
 		 169 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  34.69 
 
 		 162 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.91 
 
 		 444 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  30.53 
 
 		 168 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2510  SCP-like extracellular  30.25 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  28.21 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  28.44 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  28.57 
 
 		 353 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  30.94 
 
 		 317 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1260  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.71 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  31.78 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  35.54 
 
 		 524 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  30.94 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1146  SCP-like extracellular  31.75 
 
 		 351 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.582279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  30.56 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1117  SCP-like extracellular  31.75 
 
 		 351 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  32.95 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  21.57 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  30.28 
 
 		 320 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  31.07 
 
 		 294 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>