161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2095 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  55.03 
 
 
169 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  54.36 
 
 
168 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  54.17 
 
 
170 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  54.68 
 
 
169 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  53.12 
 
 
171 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  52.78 
 
 
170 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  51.35 
 
 
171 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  45.35 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  51.08 
 
 
159 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  48.68 
 
 
168 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  51.8 
 
 
142 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  45.83 
 
 
169 aa  121  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  48.03 
 
 
168 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  45.83 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  41.72 
 
 
162 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  42.31 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  41.72 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  48.8 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  46.83 
 
 
182 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  50 
 
 
161 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  36.54 
 
 
218 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  39.67 
 
 
141 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  39.2 
 
 
246 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  41.8 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  41.53 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  37.5 
 
 
335 aa  78.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  32.7 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  38.32 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.48 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  34.06 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  32.5 
 
 
209 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  38.03 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  31.79 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  34.23 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  30 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  33.04 
 
 
338 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  32.48 
 
 
541 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  30.3 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  31.86 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  37.82 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  28.79 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  36 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  35.04 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  34.86 
 
 
255 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.04 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  31.75 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  30.56 
 
 
288 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  34.02 
 
 
200 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  27.93 
 
 
282 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  31.58 
 
 
249 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1604  Allergen V5/Tpx-1 related  32.86 
 
 
552 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0126507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  31.58 
 
 
254 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  31.3 
 
 
495 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  31.48 
 
 
286 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 
331 aa  58.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.82 
 
 
322 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  31.25 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  31.58 
 
 
328 aa  58.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  31.58 
 
 
222 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  32.46 
 
 
305 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.71 
 
 
140 aa  57.8  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
551 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  31.07 
 
 
294 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1235  Allergen V5/Tpx-1 related  33.56 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.7 
 
 
279 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  29.63 
 
 
283 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  30.77 
 
 
287 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  34.02 
 
 
353 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  28.7 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  31.03 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  31.37 
 
 
293 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3865  SCP-like extracellular  26.88 
 
 
207 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  33.04 
 
 
264 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  30.69 
 
 
283 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  30 
 
 
260 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  28.7 
 
 
283 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  28.65 
 
 
270 aa  54.7  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  33.06 
 
 
197 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  30.91 
 
 
337 aa  54.3  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  32.47 
 
 
282 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  27.78 
 
 
301 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  31.53 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  30.7 
 
 
245 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0893  Allergen V5/Tpx-1 related  27.56 
 
 
449 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.087721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.65 
 
 
568 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  30.33 
 
 
355 aa  52.4  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  30 
 
 
465 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  26.83 
 
 
242 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  29.7 
 
 
283 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  30.51 
 
 
280 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  30.77 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2258  SCP-like extracellular protein  30.71 
 
 
553 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  27.27 
 
 
300 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  29.91 
 
 
255 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>