187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  92.2 
 
 
282 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  74.1 
 
 
294 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  73.65 
 
 
301 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  74.07 
 
 
279 aa  407  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  72.35 
 
 
293 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  70.57 
 
 
293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  68.84 
 
 
283 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  67.38 
 
 
283 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  68.82 
 
 
283 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  66.67 
 
 
283 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  46.15 
 
 
310 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  49.82 
 
 
286 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  47.83 
 
 
288 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  45.53 
 
 
320 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  47.92 
 
 
206 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  48.87 
 
 
299 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  42.86 
 
 
162 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  44.06 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  37.4 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  40.15 
 
 
200 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  42.14 
 
 
200 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  38.35 
 
 
157 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  43.51 
 
 
211 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  41.86 
 
 
222 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  46.73 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.32 
 
 
213 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  38.24 
 
 
347 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  43.28 
 
 
495 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  43.52 
 
 
209 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  40.44 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  40.95 
 
 
167 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  36.5 
 
 
159 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  42.45 
 
 
180 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  43.93 
 
 
317 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  40.74 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  37.12 
 
 
541 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  36.97 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  41.51 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  40 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  41.09 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  31.88 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  38.1 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.09 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  40.57 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  37.5 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  35.11 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  35.11 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  35.11 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  35.11 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  40.45 
 
 
500 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  35.11 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  35.11 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  35.11 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  33.59 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  35.11 
 
 
270 aa  72  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  35.58 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  36.64 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  36.09 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  38.46 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  31.91 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.29 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  35.71 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  30.97 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  34.56 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  30 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  31.61 
 
 
423 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  34.48 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.63 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  34.75 
 
 
298 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  32.58 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  30.23 
 
 
176 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  33.03 
 
 
450 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  34.69 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
551 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  41 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  30.53 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  36.45 
 
 
168 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.46 
 
 
322 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  36.45 
 
 
169 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  33.9 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.03 
 
 
372 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35.61 
 
 
168 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  34.55 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  34.78 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  35 
 
 
156 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.58 
 
 
179 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.58 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  31.82 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  32.2 
 
 
235 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  31.48 
 
 
170 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.77 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  32.58 
 
 
184 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.45 
 
 
140 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  38.24 
 
 
232 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2434  SCP-like extracellular  37.7 
 
 
157 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  29.63 
 
 
180 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  35.85 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>