215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4411 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  100 
 
 
300 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  58.33 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  54.17 
 
 
232 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  52.89 
 
 
249 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  53.85 
 
 
285 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  47.9 
 
 
211 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  51.24 
 
 
205 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  50.43 
 
 
260 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  52.46 
 
 
254 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.2 
 
 
213 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  40.84 
 
 
209 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  52.94 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  39.32 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  52.99 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  40 
 
 
275 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  40 
 
 
275 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  51.67 
 
 
495 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.54 
 
 
444 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  39.43 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  39.43 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  55.26 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  39.43 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.93 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  39.43 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  38.98 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  38.38 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  38.42 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  43.57 
 
 
263 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  48.76 
 
 
180 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  45.97 
 
 
458 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  44.35 
 
 
203 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  40.62 
 
 
465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  47.58 
 
 
305 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  43.85 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  49.17 
 
 
212 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  51.24 
 
 
338 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.63 
 
 
443 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  44.63 
 
 
167 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  38.86 
 
 
242 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  47.97 
 
 
450 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  48.76 
 
 
245 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  51.22 
 
 
410 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  45.83 
 
 
244 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  47.93 
 
 
317 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  38.37 
 
 
274 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  36.48 
 
 
347 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  38.12 
 
 
290 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.62 
 
 
321 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  39.67 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  40.32 
 
 
222 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  36.32 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  41.73 
 
 
276 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  44.52 
 
 
168 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  36.07 
 
 
341 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  42.15 
 
 
500 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0346  SCP-like extracellular  38.24 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  42.74 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.8 
 
 
129 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  36.53 
 
 
258 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  40.16 
 
 
197 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  38.1 
 
 
541 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  38.06 
 
 
344 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  38.06 
 
 
214 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  34.84 
 
 
399 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  41.22 
 
 
200 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  36.36 
 
 
287 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  36.36 
 
 
287 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  35.66 
 
 
157 aa  85.9  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  37.78 
 
 
344 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  40.34 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  41.03 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  41.03 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  41.03 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  35.71 
 
 
196 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  38.06 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  41.03 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  41.03 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  41.03 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  42.97 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  36.05 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  40.15 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.69 
 
 
372 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  38.46 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  38.76 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  40.15 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  41.03 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  38.46 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  41.22 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  43.18 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  44.8 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  37.29 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  28.5 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  36.92 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  29.44 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  34.15 
 
 
194 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  40.15 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  34.07 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  36.92 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  37.69 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>