208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1293 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 
335 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  59.24 
 
 
353 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  45.62 
 
 
270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  41.09 
 
 
209 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  44.37 
 
 
317 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  42.75 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.09 
 
 
213 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  39.69 
 
 
255 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  37.12 
 
 
541 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  38.76 
 
 
264 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  37.33 
 
 
212 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  34 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  37.96 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  37.69 
 
 
171 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  39.23 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  38.93 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.11 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  34.62 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  34.03 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  36.15 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  37.4 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  35.38 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  41.32 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  41.32 
 
 
169 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.88 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.92 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  35.04 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  32.7 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  35.38 
 
 
495 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  37.19 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  37.75 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  40.3 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  34.62 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  34.59 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  38.1 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  37.04 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  34.04 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  35.61 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  35.88 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  37.93 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  34.04 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  34.04 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  34.04 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  34.03 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  32.87 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  34.04 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  34.04 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  34.04 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.92 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  37.98 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  34.04 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  34.04 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  36.11 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  29.46 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  34.03 
 
 
293 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  34.72 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  34.88 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  38.22 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  38.17 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  36.28 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.42 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  32.85 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  34.21 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  34.11 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  34.72 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  34.03 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  35.96 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  32.31 
 
 
245 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  33.76 
 
 
174 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  36.84 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.57 
 
 
178 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  29.19 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  33.79 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  31.58 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  32.35 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  31.5 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  34.48 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  38.6 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 
551 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  30.22 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  31.58 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  32.31 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  34.04 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  32.03 
 
 
242 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  33.61 
 
 
162 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  32.21 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  28.99 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.11 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  28.99 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  36.28 
 
 
450 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  37.72 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  34.45 
 
 
162 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  33.61 
 
 
193 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  36.07 
 
 
169 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  32.89 
 
 
165 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  31.54 
 
 
214 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  29.92 
 
 
182 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  30.22 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>