179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0827 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  100 
 
 
157 aa  330  4e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  38.85 
 
 
320 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  39.46 
 
 
288 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  39.58 
 
 
310 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  38.35 
 
 
282 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  42.22 
 
 
286 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  39.23 
 
 
294 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  36.49 
 
 
293 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  37.59 
 
 
301 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  36.49 
 
 
293 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  36.57 
 
 
283 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  36.84 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  35.07 
 
 
283 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  32.37 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  37.88 
 
 
299 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.4 
 
 
444 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  39.1 
 
 
282 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.66 
 
 
279 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  34.33 
 
 
283 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  35.56 
 
 
162 aa  94.7  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  34.88 
 
 
200 aa  94  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  38.17 
 
 
458 aa  94  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  34.59 
 
 
283 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  37.98 
 
 
222 aa  92  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  36.36 
 
 
222 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  30 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  35.66 
 
 
285 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.26 
 
 
443 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  34.42 
 
 
347 aa  87.4  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  36.99 
 
 
254 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  35.43 
 
 
287 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  34.09 
 
 
203 aa  85.1  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  33.09 
 
 
541 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  35.94 
 
 
300 aa  84.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  32.03 
 
 
338 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  32.33 
 
 
495 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  36.84 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  35.88 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.11 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  33.87 
 
 
264 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  36.92 
 
 
465 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.64 
 
 
213 aa  80.9  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  36.21 
 
 
338 aa  80.5  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  36 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  33.59 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  32.03 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  32.61 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  38.24 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  38.24 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  38.24 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  38.24 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  38.24 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  38.24 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  38.24 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  35.94 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  38.24 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  38.24 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  34.56 
 
 
331 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  39.78 
 
 
283 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  33.85 
 
 
226 aa  73.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  31.78 
 
 
205 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2434  SCP-like extracellular  32.72 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  39.78 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.54 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  35.43 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.03 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  33.58 
 
 
296 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  30.5 
 
 
336 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  30.6 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  31.54 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  39.74 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  29.55 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  31.58 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  33.98 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  31.03 
 
 
280 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  30.22 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  31.54 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  28.65 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  27.04 
 
 
270 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  31.58 
 
 
423 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  30.65 
 
 
399 aa  63.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  26.74 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  31.07 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  28.91 
 
 
245 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  32.26 
 
 
312 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0369  SCP-like extracellular  31.82 
 
 
570 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.879788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  30.16 
 
 
353 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  30.47 
 
 
232 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  30.77 
 
 
336 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  32.35 
 
 
500 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>