132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2897 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  54.34 
 
 
184 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  56.79 
 
 
179 aa  190  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  56.17 
 
 
179 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  61.38 
 
 
176 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.71 
 
 
199 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
209 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35 
 
 
213 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  36.04 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4232  hypothetical protein  29.6 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281804  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.53 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  32.31 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  34.86 
 
 
495 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  33.04 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  35.04 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  33.9 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  31.4 
 
 
541 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  32.52 
 
 
305 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  33.64 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  38.94 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  31.36 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  35.65 
 
 
458 aa  64.7  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  30 
 
 
283 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  30.5 
 
 
293 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  32.46 
 
 
244 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35.77 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  29.23 
 
 
283 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  32.14 
 
 
264 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  28.57 
 
 
294 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  29.08 
 
 
293 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.91 
 
 
443 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  32.58 
 
 
222 aa  61.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  30.23 
 
 
283 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.36 
 
 
321 aa  60.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  31.9 
 
 
338 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  31.34 
 
 
232 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.37 
 
 
279 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  30.51 
 
 
296 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  29.58 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  27.97 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  26.95 
 
 
310 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  31.85 
 
 
206 aa  58.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  28.46 
 
 
283 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  28.68 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  29.55 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  27.66 
 
 
288 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  28.38 
 
 
270 aa  58.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
465 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  30.48 
 
 
320 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  30.17 
 
 
254 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  32.74 
 
 
285 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  31.25 
 
 
317 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  29.14 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  29.31 
 
 
263 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  28.81 
 
 
328 aa  54.7  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  30.48 
 
 
286 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  29.31 
 
 
275 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  29.31 
 
 
275 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  29.31 
 
 
270 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  29.31 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  29.31 
 
 
270 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  30 
 
 
450 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  29.31 
 
 
275 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  29.31 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  29.31 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.5 
 
 
602 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  28.7 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  34.75 
 
 
410 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
300 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  32.65 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  35.11 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  30.77 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  26.15 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  29.08 
 
 
282 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  28.45 
 
 
276 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  26.96 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  31.75 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  27.27 
 
 
299 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  29.13 
 
 
335 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  26.96 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  30.95 
 
 
423 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  32.38 
 
 
589 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.12 
 
 
300 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  25.66 
 
 
203 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.52 
 
 
140 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  29.73 
 
 
298 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  29.82 
 
 
283 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.17 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  28.33 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.95 
 
 
372 aa  48.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  26.05 
 
 
242 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
197 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  30.91 
 
 
260 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  30.19 
 
 
168 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  31.48 
 
 
331 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  29.03 
 
 
169 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  30.66 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  31.65 
 
 
338 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  26.49 
 
 
280 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>