196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5956 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  58.82 
 
 		 260 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  50.36 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  54.26 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  44.83 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  38.53 
 
 		 465 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  40.41 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  43.62 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  52.99 
 
 		 300 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.34 
 
 		 444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  41.67 
 
 		 458 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  45.53 
 
 		 305 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  46.92 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  49.59 
 
 		 495 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  50.43 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  46.72 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  48.31 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  51.67 
 
 		 338 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  45 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  45.38 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  46.15 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  41.72 
 
 		 328 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  44.8 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  42.67 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  47.01 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.06 
 
 		 443 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  46.15 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  46.15 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  46.15 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  46.15 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  46.15 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  46.15 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  46.15 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  46.15 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  46.15 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  49.17 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  46.77 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  42.14 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.74 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  42.77 
 
 		 334 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  45.3 
 
 		 276 aa  99  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  47.06 
 
 		 317 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.38 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  38.84 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  42.5 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  39.84 
 
 		 167 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  39.34 
 
 		 541 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  35.26 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  42.75 
 
 		 168 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  37.86 
 
 		 270 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  37.21 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  38.89 
 
 		 299 aa  85.9  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  39.17 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.89 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  33.8 
 
 		 347 aa  81.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  34.62 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  36.99 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  37.3 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  40.34 
 
 		 500 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  32.43 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  40.82 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  32.43 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  28.64 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  35.46 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  43.12 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  40.71 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.92 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  29.51 
 
 		 317 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  36.72 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  34.68 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  35.9 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  33.85 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  42.11 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  35.9 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  29.58 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  38.24 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1864  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2400  SCP-like extracellular  36.7 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00828302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  28.43 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  32.12 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  32.61 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  36.52 
 
 		 287 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  36.52 
 
 		 287 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  39.84 
 
 		 188 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  42.02 
 
 		 410 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  34.78 
 
 		 341 aa  72  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  39.47 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2772  hypothetical protein  44.26 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  31.69 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  31.88 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  28.99 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  32.85 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  32.61 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  31.85 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>