219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  45.51 
 
 
226 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  56.39 
 
 
296 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  48.91 
 
 
254 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  51.88 
 
 
211 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  53.54 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  58.62 
 
 
287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  56.78 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  42.62 
 
 
465 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  50.4 
 
 
232 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  40.22 
 
 
276 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  40.64 
 
 
458 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  35.39 
 
 
305 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  50.43 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  38 
 
 
255 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.08 
 
 
444 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  50 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  47.97 
 
 
212 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  45.67 
 
 
167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  48.76 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  46.67 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  47.93 
 
 
495 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  43.75 
 
 
242 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  47.5 
 
 
338 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  48.33 
 
 
264 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  43.65 
 
 
244 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  42.98 
 
 
347 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  41.48 
 
 
283 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  34.44 
 
 
276 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  38.19 
 
 
423 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  33.89 
 
 
270 aa  99  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  40.28 
 
 
399 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  34.78 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  34.78 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  35.56 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  34.78 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  34.78 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  34.78 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  34.78 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.19 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  45.16 
 
 
334 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  40.65 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  42.62 
 
 
168 aa  95.9  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  42.42 
 
 
328 aa  95.5  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.93 
 
 
443 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  40.15 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  43.24 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.81 
 
 
372 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  42.62 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  36.59 
 
 
541 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  44.17 
 
 
205 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  41.86 
 
 
317 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  42.4 
 
 
274 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  35.71 
 
 
179 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  41.18 
 
 
450 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  40.77 
 
 
203 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  39.53 
 
 
200 aa  85.5  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  42.86 
 
 
197 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  35.88 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.51 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  36.67 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.83 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  40.59 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  40.19 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.19 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  38.93 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  39.25 
 
 
280 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  34.27 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  34.27 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  33.83 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.92 
 
 
178 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  35 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  33.08 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  35.71 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  35 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  34.17 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  34.17 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  34.75 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  34.17 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  35.04 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  34.17 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  34.17 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  34.19 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  37.7 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  28.24 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  34.17 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  29.46 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  36.22 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  37.69 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  33.9 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  33.9 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  36.03 
 
 
214 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  33.57 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2400  SCP-like extracellular  37.61 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00828302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  36.59 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  36.67 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  36.59 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>