211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1443 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  83.97 
 
 
156 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  83.97 
 
 
156 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  44.54 
 
 
338 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  39.17 
 
 
205 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
347 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  36.52 
 
 
328 aa  92.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  40.94 
 
 
541 aa  90.9  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  36.92 
 
 
212 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  36.31 
 
 
270 aa  88.2  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  37.12 
 
 
203 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.47 
 
 
322 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  35.9 
 
 
458 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  36.97 
 
 
242 aa  86.3  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.71 
 
 
443 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  39.85 
 
 
317 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  40.16 
 
 
465 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.13 
 
 
444 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  37.21 
 
 
296 aa  85.1  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.79 
 
 
321 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  38.84 
 
 
249 aa  85.1  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  37.4 
 
 
209 aa  85.1  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  40.77 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.64 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.21 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  37.1 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  31.97 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  31.97 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  40 
 
 
245 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  31.97 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  31.97 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  31.97 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  31.97 
 
 
275 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  31.97 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  31.97 
 
 
270 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  35.54 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  31.15 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  36.61 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  37.91 
 
 
264 aa  78.2  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  34.68 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  37.18 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  34.71 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  36.92 
 
 
260 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  37.19 
 
 
495 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  37.21 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  36.36 
 
 
317 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  34.09 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  37.69 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  36.36 
 
 
317 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  35.83 
 
 
264 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  36.75 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  37.19 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  32.5 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  33.98 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.48 
 
 
300 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  32.26 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  38.46 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  38.46 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  36.04 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  35.51 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  34.21 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  35.29 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  29.17 
 
 
275 aa  68.2  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
500 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  32.48 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  36.21 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  35.59 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  37.93 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  30.77 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  31.15 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  31.15 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  33.01 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  33.81 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  34.93 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  33.81 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  33.88 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  31.09 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  35.34 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  31.36 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 
335 aa  64.3  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  35.34 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  33.93 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  32.14 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  31.93 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  31.9 
 
 
450 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  34.75 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  31.62 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  35.83 
 
 
300 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  34.19 
 
 
218 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  25.81 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  30.53 
 
 
258 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  25.16 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  38.68 
 
 
410 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0344  SCP-like extracellular  27.67 
 
 
152 aa  61.2  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00450711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  38.79 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  33.64 
 
 
288 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  35.85 
 
 
299 aa  60.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.92 
 
 
602 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>