118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4389 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  100 
 
 		 182 aa  356  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  70 
 
 		 162 aa  223  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  70.62 
 
 		 162 aa  221  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  69.38 
 
 		 193 aa  217  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  84.89 
 
 		 161 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  62.76 
 
 		 164 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  46.26 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  41.1 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  40.3 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  45.61 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  42.06 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  43.08 
 
 		 141 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  41.27 
 
 		 170 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  41.22 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  39.68 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  37.9 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  39.13 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  39.13 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  37.33 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  39.13 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.26 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  35.09 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  37.58 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  37.33 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  36.71 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.34 
 
 		 347 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  39.71 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  35.59 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  40.74 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  34.97 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  36.61 
 
 		 338 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  35.04 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.93 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  36 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  36.59 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  34.68 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  35.88 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  30.83 
 
 		 335 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  34.75 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  37.07 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.07 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  34.75 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  29.75 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  33.93 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  28.32 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  31.82 
 
 		 328 aa  57.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  31.03 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  33.96 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  33.56 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.23 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  34.11 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  33.98 
 
 		 255 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  28.7 
 
 		 310 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  31.97 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  34.86 
 
 		 331 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  27.68 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  26.85 
 
 		 320 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  24.79 
 
 		 242 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  32.79 
 
 		 274 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.11 
 
 		 300 aa  51.6  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  31.25 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.45 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  31.63 
 
 		 283 aa  51.2  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  34 
 
 		 260 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  30.36 
 
 		 205 aa  50.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.75 
 
 		 322 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  34.25 
 
 		 294 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  28.97 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  27.27 
 
 		 290 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  30.09 
 
 		 264 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.52 
 
 		 279 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  28.9 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.53 
 
 		 321 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  36.27 
 
 		 287 aa  48.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1604  Allergen V5/Tpx-1 related  35.24 
 
 		 552 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0126507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  26.24 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0346  SCP-like extracellular  28.32 
 
 		 261 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  35.64 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  32.14 
 
 		 300 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  26.17 
 
 		 276 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  25.18 
 
 		 263 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  35.19 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  26.85 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02154  hypothetical protein  25.86 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.919353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  25.18 
 
 		 270 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  32.52 
 
 		 285 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  25.93 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  35.85 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  33.04 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>