208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2772 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2772  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  299  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  45.13 
 
 		 232 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  41.91 
 
 		 226 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.54 
 
 		 213 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  44.83 
 
 		 300 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  36.51 
 
 		 347 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  42.34 
 
 		 317 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  40.16 
 
 		 209 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  40.91 
 
 		 338 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  42.24 
 
 		 287 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  45.26 
 
 		 495 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  43.36 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  38.33 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  41.75 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  38.76 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.96 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  39.09 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  35.59 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  42.06 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  37.5 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  38.35 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  38.89 
 
 		 541 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  38.6 
 
 		 285 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  35.71 
 
 		 283 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  38.84 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  38.03 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  36.52 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  32.31 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  38.98 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.52 
 
 		 300 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  31.16 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  31.16 
 
 		 263 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  31.16 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  31.16 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  31.16 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  31.16 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  31.16 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  31.16 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  31.16 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  36.21 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  38.95 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  44.83 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1235  Allergen V5/Tpx-1 related  45.24 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  33.06 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  33.04 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  38.39 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  36.45 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.8 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  38.6 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  35.92 
 
 		 450 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  35.19 
 
 		 500 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  33.78 
 
 		 179 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  36.97 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.97 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  33.01 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  36.27 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  40.7 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  32.08 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  39.53 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  38.2 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  29.55 
 
 		 258 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.68 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  34.81 
 
 		 312 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  35.04 
 
 		 320 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  39.53 
 
 		 310 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.58 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  32.85 
 
 		 423 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  33.98 
 
 		 290 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  27.56 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  36.61 
 
 		 335 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  40.62 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  37.93 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  32.38 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  28.9 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.76 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  36.54 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  40.62 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  37.01 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  37.39 
 
 		 275 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 		 331 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  38.53 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  33.61 
 
 		 317 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  34.96 
 
 		 220 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  37.78 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  40.7 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.03 
 
 		 348 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  36.17 
 
 		 465 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  31.11 
 
 		 458 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  32.79 
 
 		 317 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  38.55 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.94 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  39.18 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  32.32 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  40.7 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  35.11 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  40.54 
 
 		 410 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  30 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  30 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>